38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0853 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0853  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  100 
 
 		 172 aa  355  1.9999999999999998e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2219  conserved hypothetical protein  54.91 
 
 		 183 aa  185  3e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0141  hypothetical protein  46.95 
 
 		 176 aa  143  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0775358 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0123  hypothetical protein  46.34 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0613  hypothetical protein  43.29 
 
 		 174 aa  134  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0153  hypothetical protein  48.17 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1191  hypothetical protein  45.73 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1369  hypothetical protein  44.16 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  38.73 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  37.32 
 
 		 171 aa  73.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  36.59 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  30 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  29.41 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  34.07 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  29.84 
 
 		 160 aa  47.8  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  33 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  30.65 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_587  hypothetical protein  28.29 
 
 		 196 aa  45.1  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756332  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  29.66 
 
 		 148 aa  45.1  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0619  hypothetical protein  28.48 
 
 		 209 aa  44.7  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505502  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  29.41 
 
 		 181 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  29.41 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2211  hypothetical protein  30.39 
 
 		 225 aa  43.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0692223 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  29.27 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  35.62 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1920  hypothetical protein  30.39 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341643 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  27.45 
 
 		 184 aa  42  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  27.34 
 
 		 182 aa  42  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  30.77 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0450  hypothetical protein  31.82 
 
 		 181 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  27.03 
 
 		 195 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  27.03 
 
 		 195 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1107  hypothetical protein  31.82 
 
 		 170 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0816  hypothetical protein  31.82 
 
 		 170 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2080  hypothetical protein  31.82 
 
 		 170 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  30.84 
 
 		 168 aa  40.8  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1818  hypothetical protein  31.82 
 
 		 151 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  25.17 
 
 		 194 aa  40.8  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>