23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0123 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0123  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  347  7e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0141  hypothetical protein  73.86 
 
 
176 aa  256  1e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0775358 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1191  hypothetical protein  68.75 
 
 
176 aa  231  3e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0153  hypothetical protein  70.45 
 
 
176 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2219  conserved hypothetical protein  47.85 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0613  hypothetical protein  47.4 
 
 
174 aa  157  5e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0853  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  46.34 
 
 
172 aa  142  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.313328  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1369  hypothetical protein  52.47 
 
 
181 aa  137  6e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  32.68 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  28.31 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  35.94 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  35.4 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  37 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  30.84 
 
 
182 aa  54.3  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  31.17 
 
 
195 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  30.67 
 
 
195 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  39.77 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  32.21 
 
 
195 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0648  hypothetical protein  32.53 
 
 
138 aa  42  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0149503  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0682  hypothetical protein  32.53 
 
 
138 aa  42  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.304862  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_587  hypothetical protein  32.53 
 
 
196 aa  41.2  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756332  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0619  hypothetical protein  32.53 
 
 
209 aa  40.8  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>