93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1549 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  100 
 
 
161 aa  319  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  66.46 
 
 
165 aa  227  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  66.46 
 
 
163 aa  217  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  66.46 
 
 
163 aa  217  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  48.12 
 
 
161 aa  143  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  50 
 
 
165 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  37.12 
 
 
168 aa  86.3  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  40.52 
 
 
155 aa  85.1  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  42.42 
 
 
162 aa  84.3  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  42.42 
 
 
159 aa  84  9e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  35.22 
 
 
148 aa  83.6  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  41.13 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  38.69 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  41.94 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  40.91 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  32.3 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  32.28 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  38.79 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.94 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  32.68 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  34.64 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  34.88 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  31.36 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  43.12 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  31.06 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  42.59 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7577  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  37.58 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  40.26 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5741  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  36.24 
 
 
201 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6105  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  36.24 
 
 
201 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  32.82 
 
 
171 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  32.65 
 
 
207 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  33.57 
 
 
170 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  33.57 
 
 
181 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  32.82 
 
 
171 aa  60.5  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  46.15 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6587  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  34.51 
 
 
175 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237459  normal  0.0554296 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  35.56 
 
 
181 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  26.49 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  31.78 
 
 
174 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  39.02 
 
 
165 aa  54.3  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  27.97 
 
 
185 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5679  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  35.42 
 
 
186 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000903991  normal  0.0372691 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5902  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  35.42 
 
 
186 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000787864  hitchhiker  0.00615481 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4238  hypothetical protein  27.59 
 
 
188 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0727087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  35.78 
 
 
182 aa  51.2  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4008  hypothetical protein  27.59 
 
 
188 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4082  hypothetical protein  27.59 
 
 
188 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0271621  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  34.15 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  36.27 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  34.15 
 
 
184 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  34.15 
 
 
184 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_587  hypothetical protein  35.34 
 
 
196 aa  49.3  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756332  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  23.93 
 
 
184 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  23.08 
 
 
184 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11229  hypothetical protein  31.25 
 
 
187 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0450  hypothetical protein  32.87 
 
 
181 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  30.65 
 
 
262 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  24.71 
 
 
245 aa  45.1  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2867  hypothetical protein  24.36 
 
 
178 aa  44.3  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256461  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1818  hypothetical protein  32.87 
 
 
151 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  24.63 
 
 
198 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0816  hypothetical protein  32.87 
 
 
170 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2080  hypothetical protein  32.87 
 
 
170 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2931  hypothetical protein  41.24 
 
 
178 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1107  hypothetical protein  32.87 
 
 
170 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  35.77 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0335  decarboxylase family protein  24.56 
 
 
188 aa  43.5  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  27.37 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  27.82 
 
 
210 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  27.35 
 
 
186 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  27.94 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  25 
 
 
200 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2184  hypothetical protein  27.12 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000227609  normal  0.582537 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1620  Rossmann fold nucleotide-binding protein  30.41 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.215928  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  28.24 
 
 
240 aa  43.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  21.95 
 
 
180 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0104  hypothetical protein  28.28 
 
 
174 aa  42.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  22.65 
 
 
197 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0720  hypothetical protein  25.44 
 
 
188 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00620883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0704  hypothetical protein  25.44 
 
 
188 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  25.37 
 
 
200 aa  42.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  25.95 
 
 
217 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4700  hypothetical protein  31.3 
 
 
204 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2912  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  35.82 
 
 
165 aa  42  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  24.63 
 
 
201 aa  41.6  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  25.21 
 
 
200 aa  41.6  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  25.42 
 
 
191 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  33.97 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  25.21 
 
 
200 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  26.72 
 
 
200 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2192  hypothetical protein  24.35 
 
 
180 aa  40.8  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261149  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  26.35 
 
 
197 aa  40.8  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>