28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_587 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_587  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756332  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0619  hypothetical protein  94.39 
 
 		 209 aa  380  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505502  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0682  hypothetical protein  93.48 
 
 		 138 aa  263  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.304862  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0648  hypothetical protein  93.48 
 
 		 138 aa  263  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0149503  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  29.28 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  30.26 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.22 
 
 		 165 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  30.34 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  30.67 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  30.99 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  30.06 
 
 		 163 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  30.06 
 
 		 163 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  30 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  36.15 
 
 		 155 aa  49.7  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  33.86 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  35.34 
 
 		 161 aa  49.3  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  34.11 
 
 		 176 aa  48.1  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  34.11 
 
 		 162 aa  46.2  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1369  hypothetical protein  37.5 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0613  hypothetical protein  27.22 
 
 		 174 aa  45.4  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  25.15 
 
 		 166 aa  45.4  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0853  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  28.29 
 
 		 172 aa  45.1  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  32.58 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  32.06 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  31.52 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0141  hypothetical protein  29.63 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0775358 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.75 
 
 		 169 aa  42  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0123  hypothetical protein  32.53 
 
 		 176 aa  41.2  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>