130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2925 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  45.16 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  41.73 
 
 		 157 aa  88.2  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  41.94 
 
 		 154 aa  87.4  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  35.8 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  43.8 
 
 		 148 aa  85.5  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  45.08 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  34.59 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  36.97 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  43.36 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  41.46 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  41.46 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  42.31 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  34.81 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  35.29 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  33.57 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.69 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2931  hypothetical protein  32.79 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  35.83 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  39.67 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  33.09 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  36.79 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  32.94 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  32.94 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  44.35 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  28.9 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  36.76 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  27.85 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  38.1 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  37.27 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  37.27 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  38.1 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  37.27 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.74 
 
 		 165 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  33.05 
 
 		 162 aa  62  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0816  hypothetical protein  42.86 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1107  hypothetical protein  42.86 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2080  hypothetical protein  42.86 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1818  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0450  hypothetical protein  42.86 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  33.62 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  38.68 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  35.96 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  30.71 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  39.37 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  27.69 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  33.88 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.32 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  38.24 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0123  hypothetical protein  30.84 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  36.59 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  39.44 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  33.81 
 
 		 252 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  33.81 
 
 		 252 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  32.46 
 
 		 247 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  32.46 
 
 		 247 aa  52  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0464  hypothetical protein  26.02 
 
 		 235 aa  52  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  33.09 
 
 		 252 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  32.46 
 
 		 218 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  33.57 
 
 		 249 aa  51.2  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  35.78 
 
 		 161 aa  51.2  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  32.86 
 
 		 249 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  32.86 
 
 		 249 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  33.09 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  34.21 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  33.09 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  34.21 
 
 		 241 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  33.09 
 
 		 252 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  33.09 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  50.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  32.86 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  32.86 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  32.86 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  32.86 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  32.86 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  30.97 
 
 		 243 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1369  hypothetical protein  26.62 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0164  hypothetical protein  27.53 
 
 		 242 aa  48.5  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2912  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  35 
 
 		 165 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  32.74 
 
 		 241 aa  48.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2015  hypothetical protein  34.07 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5741  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  29.08 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6105  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  29.08 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  32.24 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  28.47 
 
 		 263 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  24.14 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2452  hypothetical protein  31.65 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0299  hypothetical protein  26.71 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000150026  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0613  hypothetical protein  24.49 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6587  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  29.33 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237459  normal  0.0554296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3844  hypothetical protein  38.03 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.991912  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3379  hypothetical protein  34.07 
 
 		 260 aa  46.2  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0476  hypothetical protein  32.14 
 
 		 218 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  41.27 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7577  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  29.93 
 
 		 199 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  29.2 
 
 		 263 aa  45.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  31.65 
 
 		 283 aa  45.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  27.84 
 
 		 245 aa  45.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  32.46 
 
 		 263 aa  45.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>