198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4351 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  300  5.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  46.27 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  50.7 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  43.08 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  37.16 
 
 		 159 aa  97.1  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  47.24 
 
 		 148 aa  94.4  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  38.82 
 
 		 176 aa  94  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  37.78 
 
 		 162 aa  94  7e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  33.33 
 
 		 163 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3844  hypothetical protein  48.99 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.991912  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  33.33 
 
 		 163 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  40.91 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  36 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  32.3 
 
 		 161 aa  90.5  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  41.43 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  32.3 
 
 		 165 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  42.52 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  40.91 
 
 		 157 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2912  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  61.76 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  40.37 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  54.4 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  41.22 
 
 		 149 aa  77  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  44.08 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  48.95 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  36.43 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.03 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  42.48 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  42.48 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.52 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  37.5 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  40.54 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  29.88 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  37.98 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  36.44 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  36.62 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  34.4 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  42.2 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  36.59 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  44.72 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  44.72 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  44.72 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0450  hypothetical protein  42.48 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  33.06 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  39.39 
 
 		 199 aa  57  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  32.67 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  32.2 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  27.16 
 
 		 245 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1818  hypothetical protein  41.18 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  27.54 
 
 		 216 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0816  hypothetical protein  41.18 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1107  hypothetical protein  41.18 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2080  hypothetical protein  41.18 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  27.42 
 
 		 181 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  29.71 
 
 		 245 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  32.06 
 
 		 262 aa  51.2  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  32.14 
 
 		 211 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  33.9 
 
 		 199 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  34.33 
 
 		 280 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  28.57 
 
 		 240 aa  50.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  30.09 
 
 		 245 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  33 
 
 		 245 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1620  Rossmann fold nucleotide-binding protein  31.19 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.215928  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  30.94 
 
 		 273 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  32.67 
 
 		 207 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0335  decarboxylase family protein  30.09 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0899  hypothetical protein  33.74 
 
 		 340 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.114072  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19460  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  35.09 
 
 		 288 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0125018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  33.05 
 
 		 199 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  32.56 
 
 		 268 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  36.61 
 
 		 192 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  32.5 
 
 		 200 aa  47.8  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  35.58 
 
 		 193 aa  47.8  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  31.09 
 
 		 243 aa  47.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  32.76 
 
 		 207 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7577  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  34.44 
 
 		 199 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  36.52 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0704  hypothetical protein  30.97 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0720  hypothetical protein  30.97 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00620883  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  32.5 
 
 		 263 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  34.81 
 
 		 283 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  32.2 
 
 		 269 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2192  hypothetical protein  35.92 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  31.01 
 
 		 267 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  33.33 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  29.01 
 
 		 235 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  31.9 
 
 		 207 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0139  hypothetical protein  33.82 
 
 		 217 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  28.03 
 
 		 242 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  37.93 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2032  hypothetical protein  25.42 
 
 		 222 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  29.82 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  29.91 
 
 		 200 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11229  hypothetical protein  31.82 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0164  hypothetical protein  28.03 
 
 		 242 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0613  hypothetical protein  27.35 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  37.07 
 
 		 195 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38540  hypothetical protein  32.14 
 
 		 359 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6105  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  34.44 
 
 		 201 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>