242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4352 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  100 
 
 		 168 aa  332  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  51.23 
 
 		 170 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  51.23 
 
 		 181 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  52.47 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  52.47 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  52.47 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0450  hypothetical protein  51.85 
 
 		 181 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0816  hypothetical protein  51.23 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1107  hypothetical protein  51.23 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2080  hypothetical protein  51.23 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1818  hypothetical protein  53.42 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  41.55 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  42.4 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  42.4 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  39.01 
 
 		 176 aa  95.9  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  44.7 
 
 		 148 aa  96.3  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  48.74 
 
 		 160 aa  95.5  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  44.37 
 
 		 148 aa  95.1  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.31 
 
 		 165 aa  94  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  45.38 
 
 		 155 aa  93.6  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  41.94 
 
 		 165 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.46 
 
 		 161 aa  91.3  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  44.54 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  40.15 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  37.12 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  36.88 
 
 		 152 aa  84.7  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  39.53 
 
 		 149 aa  84.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  39.71 
 
 		 154 aa  84.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  41.18 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  36.84 
 
 		 157 aa  84  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  47.66 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  46.32 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  38.66 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  38.66 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  41.01 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  39.23 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  32.14 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  40.37 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2912  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  40.21 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  36.63 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  46.43 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  45.24 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  35.77 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  36.79 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2032  hypothetical protein  38.32 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  44.54 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  41.75 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  34.29 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  35.85 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  36.54 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  39.36 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  39.36 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1602  hypothetical protein  40.82 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  38.6 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  37.74 
 
 		 283 aa  62  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0299  hypothetical protein  30.36 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000150026  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  31.13 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  35 
 
 		 262 aa  60.8  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0709  hypothetical protein  31.09 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  46.27 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1441  hypothetical protein  34.95 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00785449  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  58.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  28.67 
 
 		 266 aa  57.8  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  30.65 
 
 		 267 aa  58.2  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0170  hypothetical protein  31.69 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177593 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  38.04 
 
 		 239 aa  57.8  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  35 
 
 		 263 aa  57.4  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  30.22 
 
 		 280 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  29.5 
 
 		 216 aa  57  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  39.53 
 
 		 275 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3379  hypothetical protein  30.77 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  39.36 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3898  hypothetical protein  31 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  34.02 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  30.83 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  34.62 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  34.65 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  33.96 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  35.78 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  36.36 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  34.02 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  34.02 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  34.74 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  32 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  33.06 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  32 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  32 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  31.72 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  32 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  33.01 
 
 		 261 aa  54.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1201  hypothetical protein  35.51 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  32 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  34.29 
 
 		 245 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  34.95 
 
 		 263 aa  54.7  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  33.06 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1018  hypothetical protein  32.04 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>