194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2479 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  311  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  60.27 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  52.41 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  48.34 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  52.05 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  45.75 
 
 		 159 aa  120  7e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  58.33 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  45.1 
 
 		 162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  43.79 
 
 		 162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  48.25 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  48.2 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  49.58 
 
 		 146 aa  107  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  44.44 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  41.21 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  40.15 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  41.84 
 
 		 161 aa  97.4  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  49.04 
 
 		 154 aa  94.4  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  45.26 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  43.08 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  43.08 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.86 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  37.57 
 
 		 184 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.88 
 
 		 161 aa  91.3  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  38.97 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  49.66 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3844  hypothetical protein  45.64 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.991912  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  43.36 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  46.67 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  39.37 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  45.24 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  34.09 
 
 		 207 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  36.96 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.31 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  35.86 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  35.86 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  37.5 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  33.94 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2912  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  41.54 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1818  hypothetical protein  34.04 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  33.94 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0816  hypothetical protein  34.04 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1107  hypothetical protein  34.04 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0450  hypothetical protein  34.04 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2080  hypothetical protein  34.04 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  39.84 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  39.23 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  39.23 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  30.08 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  35.71 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  34.78 
 
 		 280 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  34.4 
 
 		 275 aa  57.4  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  34.19 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2800  hypothetical protein  34.11 
 
 		 275 aa  57  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.983756  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  34.43 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  32.5 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2520  hypothetical protein  34.11 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  33.61 
 
 		 283 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  32.23 
 
 		 263 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  32.11 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  31.75 
 
 		 262 aa  53.9  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  32.56 
 
 		 289 aa  53.9  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  31.82 
 
 		 267 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  35.71 
 
 		 279 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  33.33 
 
 		 266 aa  53.5  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  31.34 
 
 		 267 aa  53.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  30.33 
 
 		 278 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1201  hypothetical protein  34.88 
 
 		 243 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  38.24 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3171  hypothetical protein  32.74 
 
 		 260 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  38.24 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7577  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  30.34 
 
 		 199 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3840  hypothetical protein  36.59 
 
 		 201 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.054425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  28.91 
 
 		 241 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  35.71 
 
 		 185 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3118  hypothetical protein  35.64 
 
 		 207 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0494504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2931  hypothetical protein  35.88 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  32.2 
 
 		 243 aa  51.6  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  30 
 
 		 263 aa  51.2  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  32.23 
 
 		 264 aa  50.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5902  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  28.99 
 
 		 186 aa  50.8  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000787864  hitchhiker  0.00615481 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5679  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  28.99 
 
 		 186 aa  50.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000903991  normal  0.0372691 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  31.82 
 
 		 248 aa  50.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19460  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  33.61 
 
 		 288 aa  50.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0125018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  27.5 
 
 		 266 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  30.33 
 
 		 245 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1620  Rossmann fold nucleotide-binding protein  32.58 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.215928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  31.09 
 
 		 217 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  30 
 
 		 273 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11229  hypothetical protein  34.92 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  31.09 
 
 		 245 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  35 
 
 		 239 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  30.58 
 
 		 332 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.237559 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2219  conserved hypothetical protein  34.17 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1241  Rossmann fold nucleotide-binding protein  30 
 
 		 198 aa  48.5  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  34.31 
 
 		 197 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2968  Rossmann fold nucleotide-binding protein  32.48 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  30.33 
 
 		 266 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>