More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1620 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1620  Rossmann fold nucleotide-binding protein  100 
 
 		 183 aa  376  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.215928  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1241  Rossmann fold nucleotide-binding protein  56.35 
 
 		 198 aa  216  1e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  44.24 
 
 		 196 aa  148  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  41.44 
 
 		 195 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  41.21 
 
 		 195 aa  147  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  40.88 
 
 		 195 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  40.88 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6657  hypothetical protein  41.07 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  39.46 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0702  hypothetical protein  41.42 
 
 		 188 aa  142  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  36.93 
 
 		 230 aa  141  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  37.22 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  42.44 
 
 		 178 aa  141  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  38.55 
 
 		 200 aa  141  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0335  decarboxylase family protein  34.44 
 
 		 188 aa  141  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0720  hypothetical protein  34.44 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00620883  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  37.43 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0704  hypothetical protein  34.44 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  39.23 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  36.36 
 
 		 194 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  38.86 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  40.76 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  33.89 
 
 		 180 aa  137  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  37.93 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1214  hypothetical protein  41.03 
 
 		 182 aa  135  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  35.8 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2192  hypothetical protein  36.31 
 
 		 180 aa  135  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  37.34 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3627  hypothetical protein  37.78 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  39.23 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  38.67 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  36.52 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  39.62 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  40.79 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  36.21 
 
 		 195 aa  135  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  35.56 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  40.51 
 
 		 200 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  39.49 
 
 		 179 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4878  hypothetical protein  37.22 
 
 		 192 aa  134  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000403902  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  38.99 
 
 		 200 aa  134  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5199  decarboxylase family protein  36.67 
 
 		 192 aa  134  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00410284  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  35.39 
 
 		 194 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  42.77 
 
 		 200 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1153  hypothetical protein  39.44 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1392  hypothetical protein  41.52 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  34.44 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  37.5 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  38.64 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09413  hypothetical protein  35 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  36.11 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  41.61 
 
 		 180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0446  hypothetical protein  42.77 
 
 		 235 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  42.14 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1393  hypothetical protein  36.67 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  40.62 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  38.71 
 
 		 201 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0048  decarboxylase family protein  36.67 
 
 		 192 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  hitchhiker  2.41999e-17 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1920  hypothetical protein  34.66 
 
 		 225 aa  131  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1111  hypothetical protein  37.43 
 
 		 182 aa  131  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  40 
 
 		 196 aa  131  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  37.36 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4917  hypothetical protein  36.11 
 
 		 192 aa  131  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4781  lysine decarboxylase family protein  36.67 
 
 		 192 aa  131  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1143  hypothetical protein  38.98 
 
 		 181 aa  131  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  37.36 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5294  hypothetical protein  36.11 
 
 		 192 aa  131  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0706434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5209  decarboxylase family protein  36.11 
 
 		 192 aa  131  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  36.16 
 
 		 200 aa  131  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  131  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  37.82 
 
 		 199 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  40 
 
 		 207 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2211  hypothetical protein  36.42 
 
 		 225 aa  130  7.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0692223 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3133  hypothetical protein  35.75 
 
 		 193 aa  130  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5194  decarboxylase family protein  36.67 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0328593  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0909  hypothetical protein  37.64 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  34.27 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5162  decarboxylase family protein  36.11 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26844e-44 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4762  lysine decarboxylase family protein  36.11 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00134266  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1062  hypothetical protein  34.44 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  36.87 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79930  predicted protein  33.83 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.529779  normal  0.351185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4116  hypothetical protein  37.22 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  36.11 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2020  hypothetical protein  32.78 
 
 		 193 aa  128  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1984  hypothetical protein  35.03 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  39.88 
 
 		 205 aa  128  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  37.58 
 
 		 197 aa  128  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  36.81 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2040  hypothetical protein  37.29 
 
 		 186 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0660714  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  36.11 
 
 		 193 aa  127  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  37.93 
 
 		 203 aa  127  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  35.2 
 
 		 190 aa  127  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  35.03 
 
 		 186 aa  127  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  36 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  40.13 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  35 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  34.64 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  34.62 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  34.62 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  36.31 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>