247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0512 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  286  8e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  52.03 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  54.17 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  57.55 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  51.68 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  52.78 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  55.07 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  44.44 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  46.41 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  45.75 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  48.68 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  48.39 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  47.14 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  46.48 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  49.66 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  54.67 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  47.86 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  41.06 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3844  hypothetical protein  55.33 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.991912  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  48.39 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  48.95 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  50 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  46.22 
 
 		 168 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  36.71 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  36.71 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  41.13 
 
 		 165 aa  87  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  44.14 
 
 		 171 aa  86.3  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  44.14 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  37.5 
 
 		 184 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.17 
 
 		 161 aa  84.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  38 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  37.3 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  43.41 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  46.75 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  41.67 
 
 		 199 aa  77  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  46.22 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  46.22 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  36 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  34.44 
 
 		 161 aa  73.6  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  34.51 
 
 		 273 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  38.05 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  46.51 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  46.51 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  46.51 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  37.31 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  32.52 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  40.71 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  32.46 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  33.33 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  39.18 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2931  hypothetical protein  44.27 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2912  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  47.06 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0450  hypothetical protein  47.06 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  38.05 
 
 		 275 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  35.56 
 
 		 278 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3379  hypothetical protein  35.46 
 
 		 260 aa  61.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  40.65 
 
 		 245 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  39.64 
 
 		 280 aa  60.8  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  36.36 
 
 		 260 aa  60.5  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1818  hypothetical protein  46.22 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  36.21 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  38.94 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2080  hypothetical protein  46.22 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  34.51 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  37.59 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  33.81 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0816  hypothetical protein  46.22 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1107  hypothetical protein  46.22 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  38.06 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  35.66 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  37.29 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  34.81 
 
 		 267 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  33.63 
 
 		 317 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  33.63 
 
 		 317 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  32.46 
 
 		 252 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  32.46 
 
 		 252 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  32.46 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  36.04 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  31.58 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  31.86 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  32.46 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  34.51 
 
 		 313 aa  57  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  32.46 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19460  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  38.94 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0125018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  36.57 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  34.03 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  31.91 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  31.58 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  37.04 
 
 		 332 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  31.58 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  31.58 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2800  hypothetical protein  36.84 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.983756  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  35.4 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  31.58 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  32.74 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  33.91 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  32.74 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  33.63 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2520  hypothetical protein  33.53 
 
 		 260 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177513 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  33.63 
 
 		 241 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>