203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1030 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  100 
 
 
169 aa  340  4e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  41.86 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  37.95 
 
 
162 aa  104  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  43.55 
 
 
207 aa  103  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  37.95 
 
 
159 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  34.73 
 
 
162 aa  100  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  44.7 
 
 
155 aa  96.3  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  44.35 
 
 
176 aa  95.5  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  45.9 
 
 
160 aa  92.8  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.64 
 
 
165 aa  91.7  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  36.59 
 
 
148 aa  91.7  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  36.69 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  43.36 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  43.36 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  38.74 
 
 
162 aa  85.9  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  37.5 
 
 
157 aa  85.1  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  39.34 
 
 
149 aa  85.1  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  37.31 
 
 
199 aa  85.1  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  43.1 
 
 
161 aa  84.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  38.27 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  32.14 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  34.84 
 
 
181 aa  82  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  39.5 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  42.57 
 
 
154 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  47.06 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  38.18 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.38 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  33.59 
 
 
157 aa  77  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  34.42 
 
 
171 aa  77  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  36.51 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  36.51 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  38.28 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  31.82 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  35.78 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  31.58 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  38.19 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  40.91 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  40.91 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  40.91 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  37.74 
 
 
158 aa  67  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  29.88 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0450  hypothetical protein  37.3 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1818  hypothetical protein  42.03 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  37.75 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0816  hypothetical protein  42.03 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1107  hypothetical protein  42.03 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2080  hypothetical protein  42.03 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2931  hypothetical protein  36.36 
 
 
178 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3844  hypothetical protein  38.52 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.991912  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  33.63 
 
 
279 aa  54.7  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  32.43 
 
 
252 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  32.43 
 
 
252 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  32.43 
 
 
252 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  32.43 
 
 
252 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  27.16 
 
 
225 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  32.43 
 
 
252 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_587  hypothetical protein  34.75 
 
 
196 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756332  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  33.67 
 
 
249 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  34.65 
 
 
252 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  34.65 
 
 
252 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  30.66 
 
 
283 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  30.92 
 
 
230 aa  52.4  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  32.35 
 
 
263 aa  52.4  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  27.98 
 
 
267 aa  52  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  32.74 
 
 
262 aa  51.6  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0619  hypothetical protein  33.81 
 
 
209 aa  51.6  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505502  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  34.31 
 
 
264 aa  51.2  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  36.26 
 
 
275 aa  51.2  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  33.33 
 
 
266 aa  51.2  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  33.67 
 
 
267 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  32.65 
 
 
249 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  32.65 
 
 
249 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  33.33 
 
 
280 aa  51.2  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3171  hypothetical protein  32.74 
 
 
260 aa  50.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  32.65 
 
 
244 aa  50.8  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  32.65 
 
 
244 aa  50.8  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  32.65 
 
 
244 aa  50.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  32.65 
 
 
244 aa  50.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  32.65 
 
 
244 aa  50.8  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  33.33 
 
 
268 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0613  hypothetical protein  25.69 
 
 
174 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  31.63 
 
 
218 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  30.84 
 
 
241 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  29.81 
 
 
278 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  31.63 
 
 
247 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  27.33 
 
 
258 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  31 
 
 
283 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  31.63 
 
 
247 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3379  hypothetical protein  31.63 
 
 
260 aa  49.7  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  31.68 
 
 
289 aa  49.7  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  27.19 
 
 
266 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  34 
 
 
247 aa  49.7  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3898  hypothetical protein  32.32 
 
 
261 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  30.15 
 
 
247 aa  50.1  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  35.79 
 
 
313 aa  49.7  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2219  conserved hypothetical protein  28.26 
 
 
183 aa  48.9  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1620  Rossmann fold nucleotide-binding protein  29.66 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.215928  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  25.32 
 
 
273 aa  49.3  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  35 
 
 
251 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>