205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0462 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  328  2e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  59.06 
 
 
171 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  59.06 
 
 
171 aa  207  5e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  57.74 
 
 
181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  52.94 
 
 
174 aa  175  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  39.63 
 
 
184 aa  117  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0613  hypothetical protein  32.72 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2219  conserved hypothetical protein  37.98 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0123  hypothetical protein  28.31 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  40.54 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1369  hypothetical protein  32.17 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  33.09 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0141  hypothetical protein  26.92 
 
 
176 aa  63.9  0.0000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0775358 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  44.44 
 
 
152 aa  63.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  35.04 
 
 
146 aa  62.4  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0853  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  30 
 
 
172 aa  62  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.313328  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  35.83 
 
 
149 aa  61.6  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  32.43 
 
 
159 aa  61.2  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  35.94 
 
 
162 aa  61.2  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  60.5  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  33.85 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  38.32 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  31.58 
 
 
169 aa  58.9  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  40.78 
 
 
163 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  40.78 
 
 
163 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  35 
 
 
154 aa  58.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  35.65 
 
 
199 aa  58.2  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  35.83 
 
 
170 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  29.01 
 
 
176 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  35.83 
 
 
181 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1191  hypothetical protein  29.38 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  23.57 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  38.32 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  36.44 
 
 
148 aa  55.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3045  hypothetical protein  28.17 
 
 
342 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00166986  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  27.67 
 
 
255 aa  55.1  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3898  hypothetical protein  27.39 
 
 
261 aa  54.7  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0153  hypothetical protein  29.45 
 
 
176 aa  54.7  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  23.46 
 
 
279 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  28.22 
 
 
217 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  31.13 
 
 
240 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  27.56 
 
 
258 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3064  hypothetical protein  27.46 
 
 
342 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00713435  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  28.38 
 
 
229 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  37.66 
 
 
168 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  39.18 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  27.46 
 
 
296 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1904  decarboxylase family protein  26.24 
 
 
342 aa  52  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0178748  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  28.08 
 
 
247 aa  51.6  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  30.19 
 
 
289 aa  51.6  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  32.28 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  33.66 
 
 
165 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3710  hypothetical protein  28.77 
 
 
351 aa  51.6  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  27.39 
 
 
260 aa  51.2  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  30.23 
 
 
247 aa  50.8  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1602  hypothetical protein  28 
 
 
218 aa  50.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  29.45 
 
 
266 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  26.75 
 
 
262 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  24.02 
 
 
267 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  35.71 
 
 
243 aa  49.7  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  26.28 
 
 
263 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  36.27 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  31 
 
 
299 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  31.58 
 
 
245 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  29.23 
 
 
266 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1780  hypothetical protein  26.67 
 
 
218 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00264225  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  37.35 
 
 
275 aa  48.5  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  36.84 
 
 
332 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1267  hypothetical protein  23.84 
 
 
342 aa  48.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.13698e-16  decreased coverage  0.00000000000243562 
 
 
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  36.07 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0404  Rossmann fold nucleotide-binding protein  26.37 
 
 
221 aa  48.1  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.115936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  37.5 
 
 
241 aa  48.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  24.68 
 
 
270 aa  48.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  26.03 
 
 
243 aa  48.5  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  31.31 
 
 
280 aa  47.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  28.17 
 
 
273 aa  48.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  26.11 
 
 
245 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  27.56 
 
 
199 aa  48.1  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  27.27 
 
 
297 aa  47.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3379  hypothetical protein  36.9 
 
 
260 aa  47.4  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  28.78 
 
 
161 aa  47.8  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  26.76 
 
 
276 aa  47.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  30.32 
 
 
263 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11220  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  26.09 
 
 
266 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124999  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  24.58 
 
 
248 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  26.88 
 
 
245 aa  46.6  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  28.19 
 
 
216 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  26.06 
 
 
271 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  32.65 
 
 
268 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  32.46 
 
 
245 aa  46.6  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_587  hypothetical protein  25.15 
 
 
196 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756332  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  33.06 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  25.29 
 
 
220 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  23.23 
 
 
289 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0328  hypothetical protein  28.14 
 
 
189 aa  45.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0335495  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  30.3 
 
 
154 aa  45.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  29.1 
 
 
178 aa  45.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  31.36 
 
 
269 aa  45.1  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0299  hypothetical protein  25.95 
 
 
244 aa  45.1  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000150026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>