More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0328 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0328  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0335495  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  50 
 
 
186 aa  201  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  54.3 
 
 
193 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  53.51 
 
 
193 aa  191  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  53.23 
 
 
193 aa  190  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  53.23 
 
 
193 aa  190  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  52.69 
 
 
193 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  50.54 
 
 
186 aa  189  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  53.51 
 
 
194 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  53.51 
 
 
194 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  53.44 
 
 
195 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  52.91 
 
 
195 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0702  hypothetical protein  49.73 
 
 
188 aa  185  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  52.91 
 
 
195 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  50.81 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  48.11 
 
 
194 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  48.11 
 
 
194 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  49.74 
 
 
195 aa  180  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  50.27 
 
 
195 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  50.27 
 
 
195 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  50.27 
 
 
195 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  50.27 
 
 
195 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  50.27 
 
 
195 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  50.27 
 
 
195 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  50.27 
 
 
195 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  47.57 
 
 
194 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  53.23 
 
 
192 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1062  hypothetical protein  45.7 
 
 
198 aa  178  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  47.03 
 
 
193 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  52.91 
 
 
195 aa  174  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  47.06 
 
 
190 aa  173  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  52.38 
 
 
195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  50.27 
 
 
193 aa  171  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2080  hypothetical protein  54.55 
 
 
193 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.723086  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  49.74 
 
 
195 aa  168  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  52.94 
 
 
193 aa  167  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  46.89 
 
 
197 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  48.6 
 
 
201 aa  166  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  54.55 
 
 
180 aa  165  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  48.6 
 
 
197 aa  164  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  48.15 
 
 
195 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  46.2 
 
 
196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06310  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  54.84 
 
 
189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  45.41 
 
 
194 aa  161  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6657  hypothetical protein  44.12 
 
 
189 aa  160  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1270  hypothetical protein  54.78 
 
 
192 aa  159  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1797  hypothetical protein  53.76 
 
 
193 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1876  hypothetical protein  53.23 
 
 
208 aa  158  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  46.32 
 
 
199 aa  157  8e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  42.7 
 
 
230 aa  157  8e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  52.98 
 
 
185 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  46.2 
 
 
194 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  45.99 
 
 
200 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1454  hypothetical protein  42.86 
 
 
182 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350903  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1153  hypothetical protein  41.57 
 
 
184 aa  153  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2182  decarboxylase family protein  52.17 
 
 
195 aa  153  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  48.82 
 
 
200 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  43.24 
 
 
194 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  49.71 
 
 
197 aa  152  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  49.71 
 
 
197 aa  152  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3199  hypothetical protein  51.63 
 
 
196 aa  151  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  42.55 
 
 
204 aa  151  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  44.09 
 
 
193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  47.06 
 
 
195 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  43.24 
 
 
194 aa  151  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2568  hypothetical protein  40.94 
 
 
190 aa  150  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  55 
 
 
337 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  46.39 
 
 
194 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  47.13 
 
 
180 aa  149  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  48.54 
 
 
196 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2422  hypothetical protein  40.35 
 
 
190 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2804  hypothetical protein  49.73 
 
 
193 aa  148  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5199  decarboxylase family protein  39.78 
 
 
192 aa  148  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00410284  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3627  hypothetical protein  40.11 
 
 
192 aa  148  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1214  hypothetical protein  44.57 
 
 
182 aa  147  7e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3118  hypothetical protein  48.11 
 
 
207 aa  147  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0494504  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5209  decarboxylase family protein  40.32 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  43.24 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1151  hypothetical protein  42.94 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1143  hypothetical protein  40.57 
 
 
181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3133  hypothetical protein  47.06 
 
 
193 aa  145  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1984  hypothetical protein  35.29 
 
 
188 aa  144  6e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  44.75 
 
 
196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0048  decarboxylase family protein  39.78 
 
 
192 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  hitchhiker  2.41999e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4878  hypothetical protein  39.78 
 
 
192 aa  144  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000403902  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4116  hypothetical protein  44.94 
 
 
198 aa  144  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4917  hypothetical protein  41.18 
 
 
192 aa  143  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4762  lysine decarboxylase family protein  41.18 
 
 
192 aa  143  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00134266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5162  decarboxylase family protein  41.18 
 
 
192 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26844e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5294  hypothetical protein  41.18 
 
 
192 aa  143  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0706434  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  48.37 
 
 
193 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  50.66 
 
 
197 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5194  decarboxylase family protein  38.71 
 
 
192 aa  142  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0328593  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2040  hypothetical protein  38.67 
 
 
186 aa  141  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0660714  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4781  lysine decarboxylase family protein  40.64 
 
 
192 aa  140  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6854  hypothetical protein  49.43 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0909873 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0720  hypothetical protein  40.38 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00620883  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  47.86 
 
 
178 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0704  hypothetical protein  40.38 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  48.68 
 
 
201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>