More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1777 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  606  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  68.99 
 
 		 287 aa  417  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  63.07 
 
 		 287 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  64.58 
 
 		 301 aa  388  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  65.16 
 
 		 287 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  63.07 
 
 		 287 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  62.72 
 
 		 287 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  62.37 
 
 		 284 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  58.25 
 
 		 289 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  54.36 
 
 		 299 aa  300  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  51.22 
 
 		 301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  55.6 
 
 		 303 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  53.12 
 
 		 299 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  50 
 
 		 285 aa  268  8e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  53.64 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  50.39 
 
 		 279 aa  261  8.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  50 
 
 		 279 aa  258  7e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  50 
 
 		 276 aa  258  9e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  51.2 
 
 		 268 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  51.79 
 
 		 291 aa  251  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  46.1 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  50.4 
 
 		 268 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  49.06 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  45.45 
 
 		 292 aa  249  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  48.39 
 
 		 305 aa  248  8e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  48.13 
 
 		 288 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  47.92 
 
 		 288 aa  247  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  50.19 
 
 		 288 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  50 
 
 		 284 aa  245  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  50.98 
 
 		 315 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  50.98 
 
 		 292 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  50.98 
 
 		 292 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  46.15 
 
 		 304 aa  238  9e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  46.27 
 
 		 288 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  46.33 
 
 		 270 aa  238  1e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  49.8 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  50.59 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  50.59 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  50.59 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  45.45 
 
 		 272 aa  235  6e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  49.4 
 
 		 285 aa  235  6e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  44.32 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  49.02 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  44.4 
 
 		 282 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  43.77 
 
 		 288 aa  231  9e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  43.18 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  45.14 
 
 		 282 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  45.1 
 
 		 275 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  47.89 
 
 		 279 aa  228  7e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  48.44 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  47.01 
 
 		 273 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  45.86 
 
 		 342 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  44.98 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  46.64 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  45.42 
 
 		 261 aa  218  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  44.31 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  46.34 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  45.08 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  43.61 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  48.35 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  54.82 
 
 		 175 aa  205  9e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  41.22 
 
 		 251 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  58.96 
 
 		 147 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  41.44 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  47.22 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  43.89 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  47.22 
 
 		 317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  46.67 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  50.68 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  37.05 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  46.37 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  44.44 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  41.81 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  53.74 
 
 		 241 aa  149  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  46.11 
 
 		 239 aa  148  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  46.11 
 
 		 239 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  49.32 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  48.98 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  37.55 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  44.44 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  48.3 
 
 		 252 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  46.84 
 
 		 241 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  48.3 
 
 		 252 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  44.2 
 
 		 225 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  48.3 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  48.3 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  48.3 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  44.5 
 
 		 216 aa  146  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  41.18 
 
 		 269 aa  146  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  37.33 
 
 		 266 aa  145  6e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  45.3 
 
 		 235 aa  145  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  39.71 
 
 		 243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  49.32 
 
 		 244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  44.44 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  45 
 
 		 260 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  51.02 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  48.3 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  51.02 
 
 		 241 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  41 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  41.11 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>