More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1077 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  84.48 
 
 		 296 aa  485  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  71.97 
 
 		 273 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  68.98 
 
 		 261 aa  358  7e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  48.47 
 
 		 288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  47.71 
 
 		 288 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  47.64 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  46.97 
 
 		 292 aa  235  7e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  46.06 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  47.13 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  47.83 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  50.42 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  50.42 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  49.21 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  45.56 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  44.76 
 
 		 276 aa  227  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  44.76 
 
 		 279 aa  227  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  48.95 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  45.98 
 
 		 301 aa  227  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  48.5 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  50 
 
 		 268 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  48.48 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  48.26 
 
 		 297 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  50.2 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  49.37 
 
 		 284 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  51.9 
 
 		 279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  44.66 
 
 		 304 aa  219  3e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  44.27 
 
 		 287 aa  219  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  45.02 
 
 		 318 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  44.88 
 
 		 287 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  44.88 
 
 		 287 aa  218  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  44.98 
 
 		 299 aa  218  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  44.48 
 
 		 319 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  47.67 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  43.91 
 
 		 282 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  44.48 
 
 		 319 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  44.48 
 
 		 319 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  43.94 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  44.48 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  44.48 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  45.96 
 
 		 301 aa  216  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  42.46 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  46.18 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  43.82 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  45.11 
 
 		 282 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  44.14 
 
 		 292 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  42.91 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  43.02 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  43.77 
 
 		 275 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  46.34 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  46.37 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  50.21 
 
 		 282 aa  206  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  44.72 
 
 		 284 aa  205  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  42.35 
 
 		 289 aa  205  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  42.59 
 
 		 342 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  42.64 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  42.86 
 
 		 285 aa  203  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  43.97 
 
 		 342 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  47.95 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  50.89 
 
 		 175 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  40.98 
 
 		 318 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  39.18 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  57.69 
 
 		 147 aa  158  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  42.67 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  45.81 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  41.29 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  40.8 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  42.58 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  43.18 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  39.35 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  40.8 
 
 		 317 aa  148  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  39.5 
 
 		 241 aa  148  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  38.68 
 
 		 252 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  38.68 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  38.68 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  38.68 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  38.68 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  40.77 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  38.83 
 
 		 239 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  42.66 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  38.1 
 
 		 241 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  38.02 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  41.2 
 
 		 241 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  40 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  37.74 
 
 		 247 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  41.07 
 
 		 241 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  37.44 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  37.74 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  38.35 
 
 		 247 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  37.74 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  37.74 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  39.39 
 
 		 220 aa  140  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  37.26 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  37.26 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  37.26 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  37.26 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  37.26 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  37.26 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  37.26 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  40.49 
 
 		 243 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0930458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>