24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1369 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1369  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  344  4e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0123  hypothetical protein  52.47 
 
 
176 aa  137  6e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0613  hypothetical protein  45.91 
 
 
174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0141  hypothetical protein  49.7 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0775358 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2219  conserved hypothetical protein  40.24 
 
 
183 aa  124  8.000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0153  hypothetical protein  48.17 
 
 
176 aa  115  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1191  hypothetical protein  49.38 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0853  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  44.16 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.313328  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  40.88 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  40.46 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  32.17 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  31.94 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  35.88 
 
 
181 aa  61.6  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  33.81 
 
 
184 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  30.6 
 
 
157 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  26.62 
 
 
182 aa  48.9  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0648  hypothetical protein  37.5 
 
 
138 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0149503  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0682  hypothetical protein  37.5 
 
 
138 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.304862  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_587  hypothetical protein  37.5 
 
 
196 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756332  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0619  hypothetical protein  37.5 
 
 
209 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505502  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  37.5 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  33.06 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  36.36 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  29.84 
 
 
176 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.19576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>