191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1584 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  307  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  59.21 
 
 
148 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  54 
 
 
176 aa  153  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  46.67 
 
 
159 aa  142  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  47.33 
 
 
162 aa  142  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  46 
 
 
162 aa  140  6e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  51.57 
 
 
160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  46.67 
 
 
155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  47.4 
 
 
148 aa  121  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  46.31 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  45.58 
 
 
157 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  47.47 
 
 
157 aa  114  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  48.34 
 
 
158 aa  111  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  44.44 
 
 
146 aa  111  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  50.96 
 
 
158 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  43.92 
 
 
149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  46.77 
 
 
154 aa  107  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  45.95 
 
 
152 aa  106  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  48.1 
 
 
156 aa  103  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3844  hypothetical protein  48.05 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.991912  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.67 
 
 
161 aa  94.4  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  45.24 
 
 
184 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  51.68 
 
 
154 aa  91.3  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  44.54 
 
 
168 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.13 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  52.5 
 
 
170 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  52.5 
 
 
181 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  47.2 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2912  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  44.57 
 
 
165 aa  85.1  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  51.26 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  51.26 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  51.26 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  37.89 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  43.24 
 
 
199 aa  79  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  40.91 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0450  hypothetical protein  52.46 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  37.31 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  37.31 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.74 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1818  hypothetical protein  62.82 
 
 
151 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0816  hypothetical protein  62.82 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1107  hypothetical protein  62.82 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2080  hypothetical protein  62.82 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  35.33 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  34.64 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  41.38 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  41.12 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  33.05 
 
 
182 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  33.85 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  35.35 
 
 
174 aa  58.9  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  31.45 
 
 
268 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  38 
 
 
262 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4700  hypothetical protein  39.8 
 
 
204 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2931  hypothetical protein  40.43 
 
 
178 aa  54.7  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  35.71 
 
 
241 aa  54.3  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  33.66 
 
 
245 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7577  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  33.1 
 
 
199 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  32.41 
 
 
247 aa  52.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  35.85 
 
 
181 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  41.94 
 
 
180 aa  52.4  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  51.6  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  32.48 
 
 
279 aa  51.2  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  37.11 
 
 
280 aa  50.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  34.17 
 
 
283 aa  50.8  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3379  hypothetical protein  31.62 
 
 
260 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  34.82 
 
 
287 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  31.54 
 
 
196 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0613  hypothetical protein  32.87 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  32.38 
 
 
317 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  30.25 
 
 
273 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  33.1 
 
 
266 aa  49.3  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  31.09 
 
 
240 aa  49.7  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  33.96 
 
 
251 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  33.99 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  38.82 
 
 
287 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  30.33 
 
 
216 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  31.43 
 
 
239 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  31.5 
 
 
297 aa  48.5  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  36.11 
 
 
185 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  31.09 
 
 
263 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  32.08 
 
 
258 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  30.77 
 
 
289 aa  48.1  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0853  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  34.07 
 
 
172 aa  48.1  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.313328  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  28.98 
 
 
245 aa  48.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  31.43 
 
 
239 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  31.68 
 
 
239 aa  47.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  33.91 
 
 
229 aa  47.8  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  32.86 
 
 
301 aa  47.8  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0619  hypothetical protein  34.11 
 
 
209 aa  47.8  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505502  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  32.17 
 
 
263 aa  47.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  31.67 
 
 
283 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  33.04 
 
 
248 aa  47.4  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  47.4  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5902  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  32.41 
 
 
186 aa  47.4  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000787864  hitchhiker  0.00615481 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5679  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  32.41 
 
 
186 aa  47.4  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000903991  normal  0.0372691 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  31.69 
 
 
313 aa  47.4  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  29.27 
 
 
245 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  36.56 
 
 
197 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1620  Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.31 
 
 
183 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.215928  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  36.56 
 
 
197 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>