228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2411 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  345  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  54 
 
 		 162 aa  153  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  60.27 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  50.94 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  48.28 
 
 		 148 aa  135  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  52.11 
 
 		 154 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  53.1 
 
 		 157 aa  134  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  50.71 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  46.1 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  45.45 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  45.03 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  48 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  46.26 
 
 		 149 aa  120  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  46.53 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  43.57 
 
 		 146 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  47.11 
 
 		 154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  38.71 
 
 		 157 aa  107  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  42.13 
 
 		 184 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  50 
 
 		 156 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  39.01 
 
 		 168 aa  95.9  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  54.17 
 
 		 154 aa  94.7  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  48.34 
 
 		 158 aa  93.2  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  45.45 
 
 		 165 aa  92.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3844  hypothetical protein  46.36 
 
 		 156 aa  91.7  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.991912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  40.65 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.35 
 
 		 169 aa  88.2  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  42.5 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  42.96 
 
 		 181 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  42.65 
 
 		 170 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  40.4 
 
 		 163 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  40.4 
 
 		 163 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.38 
 
 		 161 aa  84.3  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  41.72 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  38.69 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  38.82 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  41.61 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  41.61 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  41.61 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  43.36 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0450  hypothetical protein  43.7 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  35.71 
 
 		 199 aa  70.9  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1818  hypothetical protein  42.96 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0816  hypothetical protein  42.65 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1107  hypothetical protein  42.65 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2080  hypothetical protein  42.65 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  30 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  33.91 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2931  hypothetical protein  38.81 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2912  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  40.28 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4008  hypothetical protein  34.87 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4082  hypothetical protein  34.87 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0271621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4238  hypothetical protein  34.87 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  38 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  33.01 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  29.01 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  30.97 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  35 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  39.39 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  27.74 
 
 		 278 aa  55.1  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  31.91 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  29.17 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  28.83 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3898  hypothetical protein  29.06 
 
 		 261 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3840  hypothetical protein  37.61 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.054425 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  33 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  28.21 
 
 		 332 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  27.35 
 
 		 279 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  29.06 
 
 		 269 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  41.67 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3379  hypothetical protein  38.46 
 
 		 260 aa  53.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  33.65 
 
 		 245 aa  53.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  34.04 
 
 		 266 aa  53.1  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  31.31 
 
 		 289 aa  53.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1201  hypothetical protein  30.58 
 
 		 243 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  34.35 
 
 		 199 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  32.98 
 
 		 260 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5902  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  31.33 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000787864  hitchhiker  0.00615481 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  27.01 
 
 		 268 aa  52.4  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5679  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  31.33 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000903991  normal  0.0372691 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  27.93 
 
 		 273 aa  52.4  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  37.3 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  30.85 
 
 		 283 aa  52  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  25.13 
 
 		 241 aa  51.6  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7577  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  29.73 
 
 		 199 aa  51.2  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  30.77 
 
 		 266 aa  51.2  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  32.22 
 
 		 280 aa  50.8  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  35.07 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  30.33 
 
 		 245 aa  50.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  28.81 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  28.81 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2800  hypothetical protein  32.65 
 
 		 275 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.983756  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11229  hypothetical protein  36.22 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1241  Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.15 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  28.57 
 
 		 267 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  36.73 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  28.81 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  41.67 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0619  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505502  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  43.16 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>