146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1307 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  286  8e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  59.21 
 
 
162 aa  161  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  48.28 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  52.41 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  52.8 
 
 
154 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  45.33 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  54.25 
 
 
158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  50.7 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  44.67 
 
 
162 aa  115  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  47.3 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  44.3 
 
 
162 aa  111  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  44.06 
 
 
146 aa  110  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  41.22 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  46.21 
 
 
152 aa  108  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  46.26 
 
 
148 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  41.61 
 
 
161 aa  106  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3844  hypothetical protein  52 
 
 
156 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.991912  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  48.95 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  41.26 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  44.7 
 
 
168 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  44.26 
 
 
154 aa  94.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  52.78 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  46.27 
 
 
156 aa  92  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  48.46 
 
 
165 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  40.52 
 
 
157 aa  90.1  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  47.29 
 
 
170 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2912  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  50.57 
 
 
165 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  47.29 
 
 
181 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.21 
 
 
165 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  42.62 
 
 
184 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  40.3 
 
 
165 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  38.31 
 
 
163 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  38.31 
 
 
163 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.59 
 
 
169 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  42.97 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  42.97 
 
 
171 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  38.79 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0816  hypothetical protein  56.41 
 
 
170 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1107  hypothetical protein  56.41 
 
 
170 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0450  hypothetical protein  56.41 
 
 
181 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2080  hypothetical protein  56.41 
 
 
170 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1818  hypothetical protein  56.41 
 
 
151 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  30.91 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  44.96 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  44.96 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  44.96 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  40.54 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  35.29 
 
 
199 aa  70.1  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  40 
 
 
174 aa  70.1  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4700  hypothetical protein  34.48 
 
 
204 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  34.75 
 
 
181 aa  57  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  33.88 
 
 
182 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  36.62 
 
 
193 aa  53.9  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7577  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  34.75 
 
 
199 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4116  hypothetical protein  35.71 
 
 
198 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09413  hypothetical protein  35.48 
 
 
196 aa  51.6  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1241  Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.65 
 
 
198 aa  50.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  34.4 
 
 
241 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  38.32 
 
 
180 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0404  Rossmann fold nucleotide-binding protein  31.73 
 
 
221 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.115936 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  33.59 
 
 
289 aa  47.4  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1620  Rossmann fold nucleotide-binding protein  32.43 
 
 
183 aa  47.4  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.215928  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  32.8 
 
 
263 aa  47.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  30.84 
 
 
193 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  34.51 
 
 
192 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  34.29 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  32.14 
 
 
191 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  32.8 
 
 
201 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  34.69 
 
 
196 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5741  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  33.33 
 
 
201 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6105  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  33.33 
 
 
201 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  31.97 
 
 
266 aa  45.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0853  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  30.65 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.313328  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3171  hypothetical protein  33.81 
 
 
260 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  28.7 
 
 
273 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  32.17 
 
 
240 aa  44.3  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0702  hypothetical protein  33 
 
 
188 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2968  Rossmann fold nucleotide-binding protein  29.41 
 
 
182 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  31.86 
 
 
283 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0613  hypothetical protein  29.01 
 
 
174 aa  44.7  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  33.93 
 
 
185 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  36.17 
 
 
193 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_587  hypothetical protein  32.06 
 
 
196 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756332  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2931  hypothetical protein  40.66 
 
 
178 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  33.02 
 
 
200 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  33.68 
 
 
275 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  29.91 
 
 
251 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4878  hypothetical protein  36.79 
 
 
192 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000403902  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  32.67 
 
 
199 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38540  hypothetical protein  33.33 
 
 
359 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0619  hypothetical protein  34.91 
 
 
209 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505502  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  35.48 
 
 
186 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  32.08 
 
 
268 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3024  hypothetical protein  31.25 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.695841 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  30.4 
 
 
225 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  36.21 
 
 
267 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.240114 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>