244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5377 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  99.46 
 
 
184 aa  362  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  77.38 
 
 
170 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  72.13 
 
 
181 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0450  hypothetical protein  72.13 
 
 
181 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0816  hypothetical protein  76.79 
 
 
170 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1107  hypothetical protein  76.79 
 
 
170 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2080  hypothetical protein  76.79 
 
 
170 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1818  hypothetical protein  78.15 
 
 
151 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  52.47 
 
 
168 aa  161  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  45.16 
 
 
159 aa  105  5e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  44.35 
 
 
162 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  51.26 
 
 
162 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  41.61 
 
 
176 aa  97.8  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  42.4 
 
 
162 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  44.7 
 
 
154 aa  95.9  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  46.22 
 
 
160 aa  93.6  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  44.96 
 
 
148 aa  92.4  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  49.15 
 
 
148 aa  92.4  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  42.02 
 
 
155 aa  89.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  46.22 
 
 
154 aa  89  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  40.28 
 
 
152 aa  85.1  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  46.22 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  52.94 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  40.8 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  40.8 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  46.15 
 
 
157 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  39.37 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  39.69 
 
 
149 aa  77  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  35.66 
 
 
165 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  38.74 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  44.07 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  40 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.68 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  44.72 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.91 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  35.2 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  47.11 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  34.15 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  41 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  40.66 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  35.2 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  32.04 
 
 
273 aa  62.8  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  33.93 
 
 
241 aa  62.4  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  36.17 
 
 
239 aa  61.2  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  36.17 
 
 
245 aa  61.6  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  27.27 
 
 
225 aa  60.8  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  35.58 
 
 
239 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  31.2 
 
 
207 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  32.67 
 
 
242 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  37.62 
 
 
245 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2912  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  52.38 
 
 
165 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  37.36 
 
 
239 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  34.69 
 
 
252 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  33.67 
 
 
241 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  34.69 
 
 
252 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  34.69 
 
 
252 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  34.69 
 
 
252 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  29.25 
 
 
247 aa  58.5  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3379  hypothetical protein  33.67 
 
 
260 aa  58.5  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  33.65 
 
 
248 aa  58.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  34.69 
 
 
252 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  33.67 
 
 
249 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  34.38 
 
 
218 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  34.38 
 
 
247 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  33.67 
 
 
252 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  46.51 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  33.67 
 
 
252 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  35.16 
 
 
317 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  33.67 
 
 
241 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  34.02 
 
 
241 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3171  hypothetical protein  37.37 
 
 
260 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  34.69 
 
 
262 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  32.65 
 
 
249 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  32.65 
 
 
249 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  36.67 
 
 
275 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  31.2 
 
 
166 aa  55.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  34.38 
 
 
247 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  32.65 
 
 
244 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  32.65 
 
 
244 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  32.65 
 
 
244 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  32.65 
 
 
244 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  32.65 
 
 
244 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  27.69 
 
 
174 aa  55.5  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  33.65 
 
 
260 aa  55.5  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  31 
 
 
229 aa  55.5  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  31.91 
 
 
241 aa  55.1  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  34.41 
 
 
216 aa  55.5  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  34.74 
 
 
283 aa  55.5  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7577  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  30.72 
 
 
199 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3844  hypothetical protein  42.15 
 
 
156 aa  54.7  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.991912  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  32.67 
 
 
245 aa  54.7  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  32.67 
 
 
240 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  35.16 
 
 
317 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  35.16 
 
 
317 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  32.29 
 
 
241 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1620  Rossmann fold nucleotide-binding protein  32.77 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.215928  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  30.69 
 
 
263 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>