139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2931 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2931  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  343  5e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  48.72 
 
 
199 aa  120  7e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  34.43 
 
 
182 aa  98.2  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  37.04 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  39.01 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  40.62 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  45.38 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  44.54 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  45.08 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  38.3 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  42.5 
 
 
154 aa  80.5  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  41.18 
 
 
162 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  40.15 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  40.15 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  37.3 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  35.91 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  73.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  38.66 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  38.52 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  38.98 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.07 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  31.74 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  38.66 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  32.59 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  37.4 
 
 
155 aa  67  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  30.41 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  30.38 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  37.88 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  35.34 
 
 
161 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  35.88 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  47.11 
 
 
165 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.69 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19460  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  36.05 
 
 
288 aa  60.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0125018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  36.67 
 
 
168 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  31.34 
 
 
171 aa  58.5  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  33.06 
 
 
207 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  36.36 
 
 
170 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  36.36 
 
 
181 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7577  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  31.61 
 
 
199 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  35.34 
 
 
241 aa  54.3  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  37.39 
 
 
241 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  37.5 
 
 
332 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  37.96 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  34 
 
 
184 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  34 
 
 
184 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  34 
 
 
184 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2452  hypothetical protein  32.61 
 
 
242 aa  52  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  34.48 
 
 
241 aa  52  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5741  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  30.13 
 
 
201 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6105  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  30.13 
 
 
201 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  34.48 
 
 
241 aa  51.2  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  32.62 
 
 
252 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2968  Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.31 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  32.62 
 
 
252 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  32.62 
 
 
252 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  30.5 
 
 
247 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  32.62 
 
 
252 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6587  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  30.13 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237459  normal  0.0554296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  32.62 
 
 
252 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  31.17 
 
 
245 aa  50.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  33.62 
 
 
239 aa  50.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  33.62 
 
 
245 aa  50.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  37.72 
 
 
264 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  31.69 
 
 
249 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  42.25 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  36.52 
 
 
283 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  32.35 
 
 
263 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  32.88 
 
 
247 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  32.88 
 
 
247 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1201  hypothetical protein  35.42 
 
 
243 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  34.29 
 
 
268 aa  49.3  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  36.64 
 
 
156 aa  48.9  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  32.62 
 
 
218 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  31.39 
 
 
245 aa  48.5  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  29.41 
 
 
243 aa  48.5  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  32.35 
 
 
252 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0613  hypothetical protein  31.88 
 
 
174 aa  48.1  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  32.35 
 
 
252 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  32.61 
 
 
258 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  34.04 
 
 
275 aa  48.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  33.08 
 
 
280 aa  47.8  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5902  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  29.94 
 
 
186 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000787864  hitchhiker  0.00615481 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  28.92 
 
 
216 aa  47.8  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5679  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  29.94 
 
 
186 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000903991  normal  0.0372691 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  32.14 
 
 
245 aa  47.8  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  31.21 
 
 
241 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  50 
 
 
158 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  37.84 
 
 
283 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  23.13 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  33.04 
 
 
241 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  30.88 
 
 
249 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  30.28 
 
 
239 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  33.82 
 
 
269 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  30.88 
 
 
249 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  30.88 
 
 
244 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  30.88 
 
 
244 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  30.88 
 
 
244 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  30.88 
 
 
244 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  30.88 
 
 
244 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  26.45 
 
 
245 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>