More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2968 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2968  Rossmann fold nucleotide-binding protein  100 
 
 		 182 aa  360  5.0000000000000005e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  41.38 
 
 		 245 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  35.06 
 
 		 258 aa  89  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  34.44 
 
 		 262 aa  88.2  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  33.15 
 
 		 279 aa  85.9  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  35.42 
 
 		 241 aa  85.9  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  35.62 
 
 		 267 aa  85.9  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  36.81 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  41.67 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  35.12 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  33.53 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  39.39 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  40.91 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  28.49 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  29.03 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2520  hypothetical protein  31.55 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177513 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  30.94 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1201  hypothetical protein  39.1 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  33.33 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1780  hypothetical protein  33.59 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00264225  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  30.11 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2015  hypothetical protein  32.81 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  31.68 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0170  hypothetical protein  33.85 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  35.94 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  30.41 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  30.59 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  30.6 
 
 		 217 aa  77.8  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19460  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  33.56 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0125018 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  36.36 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  27.53 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  31.93 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0476  hypothetical protein  31.25 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  31.07 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  31.61 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  34.72 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  29.82 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3898  hypothetical protein  35.82 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  30.67 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  26.34 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  28.65 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  29.24 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0464  hypothetical protein  27.87 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  35.82 
 
 		 280 aa  75.1  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  31.82 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3379  hypothetical protein  30.06 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  28.07 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  27.07 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  29.05 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2032  hypothetical protein  32.06 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  31.03 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1602  hypothetical protein  33.08 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  34.85 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2800  hypothetical protein  30.54 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.983756  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  34.35 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  32.89 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  30.86 
 
 		 268 aa  71.2  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3171  hypothetical protein  31.36 
 
 		 260 aa  71.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11220  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  29.38 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124999  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  36.13 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0428  hypothetical protein  28.17 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0164  hypothetical protein  28.14 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  28.91 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  28.91 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  34.19 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  30.06 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1504  hypothetical protein  28.21 
 
 		 352 aa  68.9  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023514 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  36.13 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  28.14 
 
 		 247 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  67.8  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  28.92 
 
 		 252 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  26.63 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  28.92 
 
 		 252 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  28.92 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  28.92 
 
 		 252 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  28.92 
 
 		 252 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0709  hypothetical protein  27.59 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  28.74 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2655  hypothetical protein  35.77 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  28.57 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  27.17 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  29.17 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  27.62 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0899  hypothetical protein  35.77 
 
 		 340 aa  65.5  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.114072  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  26.88 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  36.04 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  28.92 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  28.92 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0567  hypothetical protein  29.01 
 
 		 242 aa  64.7  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.892575  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  28.14 
 
 		 249 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  28.14 
 
 		 244 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  28.14 
 
 		 249 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  28.14 
 
 		 244 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  28.14 
 
 		 244 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  28.14 
 
 		 244 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0299  hypothetical protein  29.84 
 
 		 244 aa  64.3  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000150026  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  28.14 
 
 		 244 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3133  hypothetical protein  31.16 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  24.58 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  24.58 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>