More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0899 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0899  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  680    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.114072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0811  hypothetical protein  45.24 
 
 		 356 aa  255  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3649  hypothetical protein  42.28 
 
 		 359 aa  256  6e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3064  hypothetical protein  42.12 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00713435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4232  hypothetical protein  41.3 
 
 		 365 aa  248  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000692535 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1267  hypothetical protein  42.27 
 
 		 342 aa  248  8e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.13698e-16  decreased coverage  0.00000000000243562 
 
 
 
NC_008312  Tery_0447  hypothetical protein  40.82 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.101585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1164  hypothetical protein  42.54 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3710  hypothetical protein  42.18 
 
 		 351 aa  246  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1191  hypothetical protein  42.54 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.451053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1504  hypothetical protein  42.67 
 
 		 352 aa  245  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023514 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1904  decarboxylase family protein  41.92 
 
 		 342 aa  242  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0178748  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2655  hypothetical protein  40.19 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3045  hypothetical protein  40.48 
 
 		 342 aa  229  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00166986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2738  hypothetical protein  39.62 
 
 		 342 aa  229  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000217827  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3499  hypothetical protein  40.65 
 
 		 356 aa  229  6e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1503  hypothetical protein  38.98 
 
 		 342 aa  228  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2674  Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.98 
 
 		 342 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17550  hypothetical protein  40.33 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38540  hypothetical protein  38.54 
 
 		 359 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1525  hypothetical protein  40.33 
 
 		 356 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1177  hypothetical protein  40.2 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4028  hypothetical protein  40.2 
 
 		 372 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000330604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1283  hypothetical protein  40.45 
 
 		 357 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1631  hypothetical protein  38.85 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.430442  normal  0.107177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4031  decarboxylase family protein  40.13 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22108  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4086  hypothetical protein  38.85 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1233  hypothetical protein  39.19 
 
 		 373 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000208473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1380  hypothetical protein  39.46 
 
 		 370 aa  192  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  46.7 
 
 		 249 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  41.73 
 
 		 260 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  46.7 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  46.15 
 
 		 249 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  46.15 
 
 		 249 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  46.7 
 
 		 252 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  46.15 
 
 		 244 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  46.7 
 
 		 252 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  46.15 
 
 		 244 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  46.15 
 
 		 244 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  46.15 
 
 		 244 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  46.15 
 
 		 244 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  46.7 
 
 		 252 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  46.7 
 
 		 252 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  46.7 
 
 		 252 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  46.7 
 
 		 252 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  45.6 
 
 		 247 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  42.78 
 
 		 225 aa  158  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  46.37 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  42.36 
 
 		 241 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  45.74 
 
 		 262 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  42.58 
 
 		 245 aa  153  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  40.8 
 
 		 241 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  39.42 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  43.96 
 
 		 247 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  38.63 
 
 		 267 aa  151  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  43.72 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  44.67 
 
 		 229 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  42.61 
 
 		 267 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  41.58 
 
 		 241 aa  150  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  36.44 
 
 		 242 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  42.13 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  45.45 
 
 		 266 aa  149  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  47.16 
 
 		 258 aa  149  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  43.81 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  42.11 
 
 		 245 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  43.41 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  45.98 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  40.98 
 
 		 239 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  41.62 
 
 		 244 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  44.27 
 
 		 248 aa  146  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  43.01 
 
 		 283 aa  146  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  41.21 
 
 		 245 aa  146  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1201  hypothetical protein  39.83 
 
 		 243 aa  146  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2452  hypothetical protein  40.8 
 
 		 242 aa  146  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0164  hypothetical protein  42.39 
 
 		 242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  43.41 
 
 		 317 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  39.74 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  42.86 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  39.11 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  43.17 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0567  hypothetical protein  42.31 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.892575  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  42.94 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  43.43 
 
 		 263 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  46.02 
 
 		 279 aa  142  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  42.71 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  47.98 
 
 		 241 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  40.09 
 
 		 245 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  40.49 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  43.6 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  41.53 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  45.14 
 
 		 264 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  40.86 
 
 		 235 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  40.38 
 
 		 243 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  43.09 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0709  hypothetical protein  40 
 
 		 259 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  37.62 
 
 		 239 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  40 
 
 		 278 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  41.85 
 
 		 239 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  41.85 
 
 		 239 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  42.61 
 
 		 266 aa  139  7e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>