More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_38540 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_38540  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  743    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17550  hypothetical protein  74.37 
 
 
356 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1525  hypothetical protein  74.08 
 
 
356 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1283  hypothetical protein  75.28 
 
 
357 aa  528  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1177  hypothetical protein  68.82 
 
 
372 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4031  decarboxylase family protein  67.98 
 
 
373 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22108  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1233  hypothetical protein  67.7 
 
 
373 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000208473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1631  hypothetical protein  66.85 
 
 
372 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.430442  normal  0.107177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4086  hypothetical protein  66.85 
 
 
372 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4028  hypothetical protein  66.57 
 
 
372 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000330604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1380  hypothetical protein  66.48 
 
 
370 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3649  hypothetical protein  45.4 
 
 
359 aa  289  6e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4232  hypothetical protein  43.11 
 
 
365 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000692535 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2655  hypothetical protein  44.97 
 
 
356 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1504  hypothetical protein  45.37 
 
 
352 aa  266  5e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023514 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0447  hypothetical protein  42.42 
 
 
355 aa  265  5.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.101585  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3499  hypothetical protein  45.13 
 
 
356 aa  258  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1164  hypothetical protein  41.44 
 
 
354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1191  hypothetical protein  41.44 
 
 
354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.451053  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3045  hypothetical protein  41.35 
 
 
342 aa  249  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00166986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3710  hypothetical protein  39.82 
 
 
351 aa  246  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3064  hypothetical protein  40.12 
 
 
342 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00713435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0811  hypothetical protein  43.28 
 
 
356 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1267  hypothetical protein  38.12 
 
 
342 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.13698e-16  decreased coverage  0.00000000000243562 
 
 
 
NC_002939  GSU1904  decarboxylase family protein  37.72 
 
 
342 aa  236  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0178748  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2674  Rossmann fold nucleotide-binding protein  41.87 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1503  hypothetical protein  38.64 
 
 
342 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2738  hypothetical protein  38.35 
 
 
342 aa  226  6e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000217827  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0899  hypothetical protein  38.36 
 
 
340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.114072  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  40.61 
 
 
244 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  41.4 
 
 
243 aa  156  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  41.31 
 
 
266 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  43.72 
 
 
273 aa  156  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  43.68 
 
 
263 aa  153  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  40.54 
 
 
241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  42.04 
 
 
247 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  43 
 
 
229 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  38.43 
 
 
229 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  41.1 
 
 
249 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  37.82 
 
 
239 aa  150  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  42.11 
 
 
266 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  45.21 
 
 
245 aa  149  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  40.64 
 
 
244 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  40.64 
 
 
249 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  40.64 
 
 
244 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  40.64 
 
 
244 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  40.64 
 
 
249 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  40.64 
 
 
244 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  40.64 
 
 
244 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  39.3 
 
 
235 aa  149  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  39.06 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  39.06 
 
 
252 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  39.06 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  39.06 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  39.06 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  39.06 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  41.23 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  41.01 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  39.73 
 
 
247 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  41.15 
 
 
270 aa  145  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  38.86 
 
 
241 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  41.28 
 
 
269 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  43.24 
 
 
241 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  38.14 
 
 
241 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  47.78 
 
 
332 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  40.09 
 
 
247 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  40.1 
 
 
218 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  37.55 
 
 
241 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2452  hypothetical protein  37.56 
 
 
242 aa  143  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  43.72 
 
 
261 aa  142  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0567  hypothetical protein  41.76 
 
 
242 aa  142  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.892575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  39.37 
 
 
267 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  39.68 
 
 
242 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  44.32 
 
 
255 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  37.68 
 
 
220 aa  140  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  43.68 
 
 
245 aa  140  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  41.55 
 
 
264 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  38.05 
 
 
267 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  44.26 
 
 
240 aa  139  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  43.68 
 
 
259 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  38.89 
 
 
243 aa  139  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0164  hypothetical protein  38.6 
 
 
242 aa  139  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  42.03 
 
 
258 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2422  hypothetical protein  39.73 
 
 
241 aa  138  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113296  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  38.55 
 
 
267 aa  138  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  43.33 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  44.32 
 
 
289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  35.71 
 
 
317 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  43.16 
 
 
262 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  39.27 
 
 
266 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  39.11 
 
 
239 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  42.02 
 
 
245 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  35.36 
 
 
317 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  40.19 
 
 
283 aa  135  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  42.93 
 
 
263 aa  135  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  39.46 
 
 
239 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  36.82 
 
 
245 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  43.5 
 
 
266 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  39.56 
 
 
216 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  41.84 
 
 
279 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>