More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1283 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1283  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  732    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1525  hypothetical protein  79.44 
 
 		 356 aa  547  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17550  hypothetical protein  78.59 
 
 		 356 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38540  hypothetical protein  75.28 
 
 		 359 aa  534  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1177  hypothetical protein  70.22 
 
 		 372 aa  484  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1380  hypothetical protein  68.73 
 
 		 370 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4031  decarboxylase family protein  67.42 
 
 		 373 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22108  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4028  hypothetical protein  66.85 
 
 		 372 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000330604 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1233  hypothetical protein  65.73 
 
 		 373 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000208473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1631  hypothetical protein  65.45 
 
 		 372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.430442  normal  0.107177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4086  hypothetical protein  65.45 
 
 		 372 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3649  hypothetical protein  50.16 
 
 		 359 aa  295  8e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1504  hypothetical protein  44.54 
 
 		 352 aa  275  6e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4232  hypothetical protein  43.48 
 
 		 365 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000692535 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0447  hypothetical protein  43.26 
 
 		 355 aa  265  8.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.101585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2655  hypothetical protein  43.62 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3064  hypothetical protein  42.04 
 
 		 342 aa  255  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00713435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3045  hypothetical protein  42.81 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00166986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3710  hypothetical protein  42.22 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2738  hypothetical protein  40.12 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000217827  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1164  hypothetical protein  40.75 
 
 		 354 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1191  hypothetical protein  40.75 
 
 		 354 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.451053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3499  hypothetical protein  42.86 
 
 		 356 aa  235  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1503  hypothetical protein  39.82 
 
 		 342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2674  Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.86 
 
 		 342 aa  232  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0811  hypothetical protein  41.97 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1904  decarboxylase family protein  37.61 
 
 		 342 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0178748  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1267  hypothetical protein  39.3 
 
 		 342 aa  226  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.13698e-16  decreased coverage  0.00000000000243562 
 
 
 
NC_013124  Afer_0899  hypothetical protein  40.45 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.114072  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  43.81 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  44.44 
 
 		 229 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  46.81 
 
 		 245 aa  152  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  42.79 
 
 		 241 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  39.3 
 
 		 244 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  46.28 
 
 		 245 aa  149  8e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  40.38 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  39.39 
 
 		 252 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  39.83 
 
 		 249 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  44.38 
 
 		 273 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  38.1 
 
 		 247 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  39.39 
 
 		 252 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  43.38 
 
 		 264 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  39.39 
 
 		 249 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  39.39 
 
 		 249 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  43.84 
 
 		 289 aa  146  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  39.39 
 
 		 244 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  39.39 
 
 		 244 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  39.39 
 
 		 244 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  39.39 
 
 		 244 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  39.39 
 
 		 244 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  40.99 
 
 		 241 aa  145  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  38.96 
 
 		 252 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  38.96 
 
 		 252 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  38.96 
 
 		 252 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  42.65 
 
 		 262 aa  145  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  38.96 
 
 		 252 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  38.96 
 
 		 252 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  40.49 
 
 		 218 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  44.93 
 
 		 258 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  42.18 
 
 		 260 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  38.1 
 
 		 247 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  41.74 
 
 		 247 aa  143  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  43.69 
 
 		 267 aa  143  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  43.4 
 
 		 283 aa  142  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  39.01 
 
 		 267 aa  142  8e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  41 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  43.78 
 
 		 266 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  40.56 
 
 		 216 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  38.1 
 
 		 317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  37.96 
 
 		 229 aa  139  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  45.32 
 
 		 332 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  37.66 
 
 		 317 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  41.67 
 
 		 269 aa  139  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  37.39 
 
 		 239 aa  139  7.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  43.46 
 
 		 283 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  40.38 
 
 		 241 aa  139  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  39.91 
 
 		 239 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  41.38 
 
 		 278 aa  139  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  39.91 
 
 		 239 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  44.57 
 
 		 235 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  41.31 
 
 		 241 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  37.66 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0164  hypothetical protein  38.25 
 
 		 242 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  39.47 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  43.72 
 
 		 240 aa  137  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  42.11 
 
 		 263 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  39.04 
 
 		 220 aa  136  5e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  38.03 
 
 		 241 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  42.44 
 
 		 255 aa  136  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  43.89 
 
 		 259 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  43.78 
 
 		 245 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  43.5 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0567  hypothetical protein  38.46 
 
 		 242 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.892575  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  42.5 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  41.4 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  38.28 
 
 		 245 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  43.96 
 
 		 243 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3171  hypothetical protein  47.37 
 
 		 260 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  38.03 
 
 		 239 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  37.67 
 
 		 261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>