More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2738 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1503  hypothetical protein  97.95 
 
 		 342 aa  678    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2738  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  707    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000217827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3710  hypothetical protein  77.78 
 
 		 351 aa  549  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1904  decarboxylase family protein  73.98 
 
 		 342 aa  529  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0178748  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1267  hypothetical protein  73.39 
 
 		 342 aa  526  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.13698e-16  decreased coverage  0.00000000000243562 
 
 
 
NC_010814  Glov_3045  hypothetical protein  68.6 
 
 		 342 aa  498  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00166986  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3064  hypothetical protein  67.54 
 
 		 342 aa  499  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00713435  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2674  Rossmann fold nucleotide-binding protein  61.52 
 
 		 342 aa  431  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1164  hypothetical protein  42.73 
 
 		 354 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1191  hypothetical protein  42.73 
 
 		 354 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.451053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0447  hypothetical protein  43.2 
 
 		 355 aa  278  9e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.101585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0811  hypothetical protein  46.67 
 
 		 356 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1504  hypothetical protein  42.12 
 
 		 352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4232  hypothetical protein  40.59 
 
 		 365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000692535 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3649  hypothetical protein  46.2 
 
 		 359 aa  265  7e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2655  hypothetical protein  45.22 
 
 		 356 aa  256  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3499  hypothetical protein  41.9 
 
 		 356 aa  251  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0899  hypothetical protein  39.62 
 
 		 340 aa  239  4e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.114072  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38540  hypothetical protein  38.35 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1283  hypothetical protein  40.12 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1525  hypothetical protein  39.23 
 
 		 356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17550  hypothetical protein  38.64 
 
 		 356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1380  hypothetical protein  37.95 
 
 		 370 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1177  hypothetical protein  36.34 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4028  hypothetical protein  36.8 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000330604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4031  decarboxylase family protein  38.2 
 
 		 373 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22108  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1233  hypothetical protein  36.5 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000208473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1631  hypothetical protein  36.5 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.430442  normal  0.107177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4086  hypothetical protein  36.5 
 
 		 372 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  49.72 
 
 		 273 aa  166  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  47.83 
 
 		 244 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  41.67 
 
 		 241 aa  155  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  43.48 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  45.41 
 
 		 229 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  44.57 
 
 		 241 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  41.4 
 
 		 252 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  41.4 
 
 		 252 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  41.4 
 
 		 252 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  41.85 
 
 		 252 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  40.86 
 
 		 249 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  42.39 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  40.86 
 
 		 252 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  40.86 
 
 		 252 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  41.4 
 
 		 252 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  46.99 
 
 		 243 aa  149  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  42.02 
 
 		 266 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  40.32 
 
 		 244 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  40.32 
 
 		 249 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  41.85 
 
 		 239 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  40.32 
 
 		 249 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  40.32 
 
 		 244 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  40.32 
 
 		 244 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  40.32 
 
 		 244 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  40.32 
 
 		 244 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  45.95 
 
 		 266 aa  149  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  42.47 
 
 		 218 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  45.41 
 
 		 242 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  41.85 
 
 		 247 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  43.5 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  41.94 
 
 		 247 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  42.39 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  41.4 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  43.48 
 
 		 241 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  41.85 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  45.2 
 
 		 263 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  37.29 
 
 		 245 aa  146  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0164  hypothetical protein  43.23 
 
 		 242 aa  146  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  42.62 
 
 		 239 aa  146  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  42.54 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  42.54 
 
 		 239 aa  145  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  41.94 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  43.33 
 
 		 216 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  37.5 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  43.26 
 
 		 289 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2452  hypothetical protein  41.2 
 
 		 242 aa  142  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  36.89 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  39.78 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  44.07 
 
 		 249 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  43.89 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  42.39 
 
 		 243 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  44.86 
 
 		 235 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  41.44 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0567  hypothetical protein  41.99 
 
 		 242 aa  139  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.892575  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  41.11 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  41.3 
 
 		 241 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  41.24 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  41.67 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  42.22 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  39.04 
 
 		 220 aa  137  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1780  hypothetical protein  39.89 
 
 		 218 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00264225  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  40.78 
 
 		 280 aa  136  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  41.44 
 
 		 225 aa  135  8e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  39.78 
 
 		 279 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  39.25 
 
 		 260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  38.04 
 
 		 255 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  39.36 
 
 		 262 aa  133  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  41.9 
 
 		 332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  41.11 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  41.9 
 
 		 247 aa  132  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3898  hypothetical protein  41.08 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>