More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1233 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1233  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  772    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000208473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1631  hypothetical protein  95.7 
 
 		 372 aa  714    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.430442  normal  0.107177 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4028  hypothetical protein  92.74 
 
 		 372 aa  694    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000330604 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4086  hypothetical protein  96.24 
 
 		 372 aa  719    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1177  hypothetical protein  74.8 
 
 		 372 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4031  decarboxylase family protein  72.11 
 
 		 373 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22108  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1380  hypothetical protein  71.75 
 
 		 370 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38540  hypothetical protein  67.7 
 
 		 359 aa  485  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17550  hypothetical protein  68.17 
 
 		 356 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1525  hypothetical protein  67.32 
 
 		 356 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1283  hypothetical protein  65.73 
 
 		 357 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3649  hypothetical protein  47.9 
 
 		 359 aa  292  8e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4232  hypothetical protein  42.86 
 
 		 365 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000692535 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0447  hypothetical protein  41 
 
 		 355 aa  256  4e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.101585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2655  hypothetical protein  42.59 
 
 		 356 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1164  hypothetical protein  42.32 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1191  hypothetical protein  42.32 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.451053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3499  hypothetical protein  41.38 
 
 		 356 aa  239  5e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1504  hypothetical protein  40.5 
 
 		 352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023514 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3064  hypothetical protein  36.73 
 
 		 342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00713435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0811  hypothetical protein  40.59 
 
 		 356 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1267  hypothetical protein  36.54 
 
 		 342 aa  215  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.13698e-16  decreased coverage  0.00000000000243562 
 
 
 
NC_010814  Glov_3045  hypothetical protein  37.03 
 
 		 342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00166986  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0899  hypothetical protein  39.19 
 
 		 340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.114072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1904  decarboxylase family protein  36.22 
 
 		 342 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0178748  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3710  hypothetical protein  37.14 
 
 		 351 aa  209  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2738  hypothetical protein  36.5 
 
 		 342 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000217827  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2674  Rossmann fold nucleotide-binding protein  37.17 
 
 		 342 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1503  hypothetical protein  37.62 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  42.59 
 
 		 244 aa  166  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  39.92 
 
 		 266 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  41.12 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  46.28 
 
 		 245 aa  156  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  43.39 
 
 		 242 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  40.74 
 
 		 243 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  42.86 
 
 		 229 aa  153  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  42.99 
 
 		 240 aa  152  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  44.12 
 
 		 241 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  42.59 
 
 		 247 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  44.32 
 
 		 261 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  41.59 
 
 		 241 aa  150  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  41.78 
 
 		 229 aa  150  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  40.29 
 
 		 245 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  40.29 
 
 		 239 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  43.32 
 
 		 241 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  41.75 
 
 		 239 aa  146  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0567  hypothetical protein  42.93 
 
 		 242 aa  146  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.892575  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  44.15 
 
 		 245 aa  146  6e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  47.75 
 
 		 264 aa  146  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  44.09 
 
 		 235 aa  145  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  45.83 
 
 		 270 aa  145  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  43.93 
 
 		 266 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  38.35 
 
 		 220 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  43.32 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  43.75 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  43.85 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  46.59 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  42.78 
 
 		 247 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  40.38 
 
 		 241 aa  144  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  42.78 
 
 		 218 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  43.78 
 
 		 247 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  47.75 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  40.2 
 
 		 263 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  43.32 
 
 		 252 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  43.32 
 
 		 252 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  43.32 
 
 		 252 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  43.32 
 
 		 252 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  43.32 
 
 		 252 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  43.32 
 
 		 244 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  43.32 
 
 		 244 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  43.32 
 
 		 249 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  43.32 
 
 		 249 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  43.78 
 
 		 252 aa  143  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  43.32 
 
 		 244 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  43.32 
 
 		 244 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  43.32 
 
 		 244 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  48.3 
 
 		 267 aa  143  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  42.93 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  39.56 
 
 		 241 aa  142  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  41.06 
 
 		 259 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  43.96 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  43.27 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  47.46 
 
 		 280 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  42.93 
 
 		 267 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  42.25 
 
 		 239 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2452  hypothetical protein  41.18 
 
 		 242 aa  139  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  45 
 
 		 258 aa  139  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  43.09 
 
 		 245 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  42.7 
 
 		 239 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  41.8 
 
 		 255 aa  139  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  45.05 
 
 		 279 aa  139  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  42.16 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  43.72 
 
 		 245 aa  138  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  43.18 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  38.16 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  42.63 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0164  hypothetical protein  42.39 
 
 		 242 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  47.16 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  43.89 
 
 		 248 aa  135  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  42.16 
 
 		 317 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>