82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6587 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6587  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  100 
 
 		 175 aa  346  8e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237459  normal  0.0554296 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6105  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  97.71 
 
 		 201 aa  343  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5741  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  97.71 
 
 		 201 aa  343  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7577  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  90.64 
 
 		 199 aa  314  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5679  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  58.02 
 
 		 186 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000903991  normal  0.0372691 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5902  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  58.02 
 
 		 186 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000787864  hitchhiker  0.00615481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.16 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  35.17 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.71 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  35.56 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  34.21 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  34.21 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1241  Rossmann fold nucleotide-binding protein  28.74 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  30.08 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  31.78 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  33.57 
 
 		 198 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  33.1 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  29.32 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2040  hypothetical protein  27.27 
 
 		 186 aa  48.5  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0660714  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1984  hypothetical protein  23.98 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  31.03 
 
 		 207 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  30.18 
 
 		 199 aa  48.5  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  31.71 
 
 		 149 aa  48.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79930  predicted protein  27.96 
 
 		 223 aa  47.8  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.529779  normal  0.351185 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  31.72 
 
 		 179 aa  47.8  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  31.17 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  30.34 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  23.75 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  30.16 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  29.53 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  29.45 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  29.45 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  31.97 
 
 		 199 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1207  hypothetical protein  28.32 
 
 		 197 aa  45.4  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  32.81 
 
 		 217 aa  45.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0139  hypothetical protein  32.45 
 
 		 217 aa  45.1  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  28.93 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0899  hypothetical protein  30.05 
 
 		 340 aa  44.3  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.114072  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  29.08 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  28.75 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  29.76 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0446  hypothetical protein  29.93 
 
 		 235 aa  43.9  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  30.95 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  28.48 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  29.08 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  29.66 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  31.36 
 
 		 245 aa  43.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  31.25 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  29.08 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  33.07 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  31.97 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  29.08 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  30.71 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  29.17 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  28.47 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  34.48 
 
 		 197 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  29.37 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  32.8 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  31.85 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  27.27 
 
 		 245 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3840  hypothetical protein  29.45 
 
 		 201 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.054425 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  27.27 
 
 		 239 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  31.85 
 
 		 194 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  30.38 
 
 		 245 aa  42  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  31.47 
 
 		 186 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  28.17 
 
 		 195 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  28.17 
 
 		 195 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  28.17 
 
 		 195 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  28.17 
 
 		 195 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  27.92 
 
 		 193 aa  42  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  28.17 
 
 		 195 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  28.17 
 
 		 195 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  30.37 
 
 		 197 aa  41.6  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3379  hypothetical protein  28.49 
 
 		 260 aa  41.6  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  30.83 
 
 		 148 aa  41.6  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  30.37 
 
 		 197 aa  41.6  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  26.5 
 
 		 261 aa  41.2  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  28.93 
 
 		 245 aa  41.2  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  27.46 
 
 		 186 aa  41.2  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  28.85 
 
 		 245 aa  40.8  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  26.09 
 
 		 262 aa  40.8  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>