90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6105 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6105  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  100 
 
 
201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5741  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  100 
 
 
201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7577  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  86.29 
 
 
199 aa  345  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6587  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  98.78 
 
 
175 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237459  normal  0.0554296 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5679  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  57.58 
 
 
186 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000903991  normal  0.0372691 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5902  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  57.58 
 
 
186 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000787864  hitchhiker  0.00615481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  33.51 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  34.55 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  37.76 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  36.24 
 
 
161 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  32.4 
 
 
163 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  32.4 
 
 
163 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1241  Rossmann fold nucleotide-binding protein  28.74 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  30.08 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  28.4 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0899  hypothetical protein  29.05 
 
 
340 aa  50.1  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.114072  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1984  hypothetical protein  24.56 
 
 
188 aa  50.1  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  29.67 
 
 
200 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  29.5 
 
 
154 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  32.24 
 
 
199 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  31.72 
 
 
179 aa  48.9  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  33.57 
 
 
198 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2040  hypothetical protein  27.27 
 
 
186 aa  48.9  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0660714  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  30.81 
 
 
199 aa  48.1  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  31.71 
 
 
149 aa  48.5  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  31.03 
 
 
207 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  23.75 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  29.08 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79930  predicted protein  27.96 
 
 
223 aa  47.4  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.529779  normal  0.351185 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  30.14 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  30.34 
 
 
207 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  28.75 
 
 
171 aa  47  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  30.14 
 
 
184 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  31.03 
 
 
176 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0139  hypothetical protein  32.96 
 
 
217 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1207  hypothetical protein  25.93 
 
 
197 aa  46.2  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  31.76 
 
 
162 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  26.47 
 
 
262 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  46.2  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  28.93 
 
 
184 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  29.14 
 
 
162 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  45.8  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  32.81 
 
 
217 aa  45.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  26.15 
 
 
195 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  28.48 
 
 
193 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  31.97 
 
 
199 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  28.48 
 
 
193 aa  45.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  28.48 
 
 
193 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  28.48 
 
 
193 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  26.14 
 
 
195 aa  44.7  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0335  decarboxylase family protein  24.14 
 
 
188 aa  44.7  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  31.29 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  30.28 
 
 
162 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  33.07 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  27.27 
 
 
195 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  27.27 
 
 
195 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  28.1 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  27.27 
 
 
195 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  27.44 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  28.26 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  31.65 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0446  hypothetical protein  33.86 
 
 
235 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  27.27 
 
 
195 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  27.27 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  28.05 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  27.27 
 
 
195 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  26.52 
 
 
245 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  29.66 
 
 
206 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  26.52 
 
 
239 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  25.95 
 
 
261 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  29.37 
 
 
159 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  32.37 
 
 
160 aa  43.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  31.29 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  31.85 
 
 
205 aa  42.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3840  hypothetical protein  29.45 
 
 
201 aa  42.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.054425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3379  hypothetical protein  28.49 
 
 
260 aa  42.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  28.93 
 
 
245 aa  41.6  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  28.37 
 
 
155 aa  42  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  26.96 
 
 
279 aa  41.6  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  34.48 
 
 
197 aa  42  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  30.83 
 
 
148 aa  41.6  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  26.74 
 
 
269 aa  41.6  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  30.94 
 
 
197 aa  41.2  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  27.46 
 
 
186 aa  41.2  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  27.66 
 
 
194 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2211  hypothetical protein  27.52 
 
 
225 aa  41.6  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0692223 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  27.66 
 
 
194 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  30.94 
 
 
197 aa  41.2  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0704  hypothetical protein  23.3 
 
 
188 aa  41.2  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0720  hypothetical protein  23.3 
 
 
188 aa  41.2  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00620883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>