248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2867 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2867  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  363  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256461  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  44.64 
 
 
194 aa  159  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  43.45 
 
 
194 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1062  hypothetical protein  44.12 
 
 
198 aa  158  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  44.71 
 
 
186 aa  158  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6657  hypothetical protein  43.02 
 
 
189 aa  158  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  42.86 
 
 
194 aa  157  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  42.86 
 
 
194 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  43.2 
 
 
199 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  44.72 
 
 
199 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  42.86 
 
 
193 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  42.86 
 
 
194 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4116  hypothetical protein  41.28 
 
 
198 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  42.86 
 
 
193 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  42.86 
 
 
193 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  42.86 
 
 
193 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  41.67 
 
 
194 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  41.95 
 
 
211 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  40.23 
 
 
200 aa  154  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  42.11 
 
 
195 aa  154  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  40.94 
 
 
197 aa  154  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  40.23 
 
 
200 aa  154  9e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  40.83 
 
 
194 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  41.67 
 
 
193 aa  153  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  40.94 
 
 
197 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  41.38 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0702  hypothetical protein  42.35 
 
 
188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  44.58 
 
 
201 aa  151  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  41.62 
 
 
200 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2020  hypothetical protein  42.26 
 
 
193 aa  150  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  41.52 
 
 
195 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2211  hypothetical protein  40.85 
 
 
225 aa  150  8e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0692223 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0357  hypothetical protein  41.14 
 
 
198 aa  149  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  42.01 
 
 
194 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  42.94 
 
 
186 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1920  hypothetical protein  40.24 
 
 
225 aa  149  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  38.73 
 
 
200 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  45.75 
 
 
185 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  40.94 
 
 
195 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  40.94 
 
 
195 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  40.94 
 
 
195 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  40.94 
 
 
195 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  40.94 
 
 
195 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  41.42 
 
 
194 aa  148  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  40.35 
 
 
195 aa  148  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  39.66 
 
 
210 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  40 
 
 
184 aa  147  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  42.77 
 
 
193 aa  146  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  42.38 
 
 
230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  39.38 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  40 
 
 
184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  39.43 
 
 
206 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  41.28 
 
 
207 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  37.71 
 
 
195 aa  144  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  38.64 
 
 
195 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  40.83 
 
 
195 aa  144  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  40.7 
 
 
207 aa  144  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  38.64 
 
 
195 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  39.05 
 
 
190 aa  143  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  38.86 
 
 
195 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5199  decarboxylase family protein  41.52 
 
 
192 aa  142  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00410284  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  38.29 
 
 
184 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2568  hypothetical protein  39.88 
 
 
190 aa  142  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5525  hypothetical protein  44.91 
 
 
183 aa  142  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  41.28 
 
 
197 aa  142  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  37.5 
 
 
217 aa  141  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2422  hypothetical protein  39.29 
 
 
190 aa  141  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1392  hypothetical protein  41.28 
 
 
177 aa  141  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  40.24 
 
 
193 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  40.38 
 
 
200 aa  141  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  39.77 
 
 
178 aa  140  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  42.48 
 
 
197 aa  140  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  38.29 
 
 
195 aa  140  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  41.28 
 
 
199 aa  140  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5209  decarboxylase family protein  41.32 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  42.07 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0048  decarboxylase family protein  41.92 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  hitchhiker  2.41999e-17 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  46.81 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5194  decarboxylase family protein  41.92 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0328593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4917  hypothetical protein  40.35 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4781  lysine decarboxylase family protein  40.94 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5294  hypothetical protein  40.35 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0706434  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  38.29 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  39.53 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0446  hypothetical protein  37.5 
 
 
235 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  39.39 
 
 
196 aa  139  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3627  hypothetical protein  40.46 
 
 
192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  39.29 
 
 
193 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5162  decarboxylase family protein  39.77 
 
 
192 aa  137  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26844e-44 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3133  hypothetical protein  39.35 
 
 
193 aa  137  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  40.96 
 
 
204 aa  137  8.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  39.31 
 
 
194 aa  136  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  36.93 
 
 
200 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4762  lysine decarboxylase family protein  39.77 
 
 
192 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00134266  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  39.53 
 
 
197 aa  136  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2804  hypothetical protein  37.57 
 
 
193 aa  136  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  35.12 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06310  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  42.44 
 
 
189 aa  135  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  39.22 
 
 
200 aa  134  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>