59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2737 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2737  phage integrase-like SAM-like  100 
 
 		 300 aa  607  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.751865  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  26.09 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3046  integrase family protein  30.83 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  24.19 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  23.11 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  24.07 
 
 		 292 aa  53.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  26.87 
 
 		 359 aa  52.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4550  integrase family protein  35.96 
 
 		 362 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.798479 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5541  integrase family protein  27.24 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0614894 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  21.49 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.68 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.9 
 
 		 378 aa  50.1  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2277  phage integrase  30.83 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000555272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1488  tyrosine recombinase XerD  32.4 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  30.3 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  26.83 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  33.09 
 
 		 387 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  28.26 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  27.1 
 
 		 446 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  27.1 
 
 		 430 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  29.79 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  27.1 
 
 		 446 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  29.82 
 
 		 381 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.23 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1283  phage integrase family protein  23.62 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000135681  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1554  integrase family protein  27.08 
 
 		 339 aa  46.6  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  decreased coverage  0.00111318 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  24.92 
 
 		 320 aa  46.2  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  32 
 
 		 490 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  28.42 
 
 		 343 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  26.36 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  28.42 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  26.4 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  25.96 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  28.87 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.24 
 
 		 390 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  32.71 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  22.99 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  25 
 
 		 380 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1863  integrase family protein  31.94 
 
 		 347 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  23.15 
 
 		 426 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  23.15 
 
 		 431 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  26.4 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  23.15 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3699  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  23.44 
 
 		 402 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  33.77 
 
 		 380 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  23.44 
 
 		 401 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  26.4 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  29.03 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  29.03 
 
 		 309 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  28.24 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  28.24 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  27.98 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  29.59 
 
 		 411 aa  43.5  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  23.73 
 
 		 335 aa  43.5  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  29.05 
 
 		 383 aa  43.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  22.22 
 
 		 428 aa  43.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  29.55 
 
 		 288 aa  42.7  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3670  phage integrase family protein  22.64 
 
 		 291 aa  42.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>