More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2343 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2343  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3296  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2913  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4163  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 220 aa  151  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0353  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.45 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3088  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3815  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.681737  normal  0.25062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  41.1 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4950  two component transcriptional regulator  37.44 
 
 		 235 aa  148  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3471  putative two-component response regulator  41.1 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1280  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 225 aa  145  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1802  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2972  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  37.89 
 
 		 242 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2423  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.265311  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  37.9 
 
 		 225 aa  144  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1307  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  37.95 
 
 		 242 aa  144  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 224 aa  144  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  38.77 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  36.2 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  36.2 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3491  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 219 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  38.25 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3715  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4141  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  40.55 
 
 		 222 aa  142  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1861  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 225 aa  141  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.55 
 
 		 260 aa  141  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  37.79 
 
 		 220 aa  141  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0727  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 222 aa  141  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  37.73 
 
 		 224 aa  141  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.56 
 
 		 224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  37.27 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 242 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2149  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6599  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.91 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657401 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 242 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.28 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 273 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 282 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 282 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.56 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  37.27 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2228  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00319429  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 221 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 224 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 221 aa  138  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2733  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 242 aa  138  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00185097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5688  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 224 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0612982 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 221 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 266 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3752  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 224 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 225 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4616  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 224 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.055256 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2701  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.81 
 
 		 225 aa  138  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0392  DNA-binding transcriptional regulator BasR  41.1 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0195  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.88 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  41.55 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  38.5 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.79 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2348  two component transcriptional regulator  39.81 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000162881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  37.73 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0286  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  36.65 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>