121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3675 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3675  rod shape-determining protein MreD  100 
 
 		 162 aa  320  7e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0136907  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0254  rod shape-determining protein MreD  85.8 
 
 		 162 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0028978  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0265  rod shape-determining protein MreD  85.8 
 
 		 162 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3833  rod shape-determining protein MreD  91.36 
 
 		 162 aa  275  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4409  rod shape-determining protein MreD  81.48 
 
 		 162 aa  267  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000516669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0400  rod shape-determining protein MreD  78.4 
 
 		 162 aa  266  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.269342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1196  rod shape-determining protein MreD  78.4 
 
 		 162 aa  266  8.999999999999999e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00178529  hitchhiker  0.00199386 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0467  rod shape-determining protein MreD  78.4 
 
 		 162 aa  266  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00113622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3732  rod shape-determining protein MreD  73.12 
 
 		 163 aa  246  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.391337  normal  0.0778624 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3635  rod shape-determining protein MreD  73.12 
 
 		 163 aa  246  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148983  hitchhiker  0.00393044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3670  rod shape-determining protein MreD  73.12 
 
 		 163 aa  246  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.501294  normal  0.526814 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3564  rod shape-determining protein MreD  73.12 
 
 		 163 aa  246  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3685  rod shape-determining protein MreD  73.46 
 
 		 162 aa  245  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00121025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3563  rod shape-determining protein MreD  72.5 
 
 		 163 aa  244  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.003884  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3438  rod shape-determining protein MreD  72.22 
 
 		 162 aa  233  7e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00180798  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03108  cell wall structural complex MreBCD transmembrane component MreD  72.22 
 
 		 162 aa  233  9e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00126641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0458  rod shape-determining protein MreD  72.22 
 
 		 162 aa  233  9e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0128703  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03059  hypothetical protein  72.22 
 
 		 162 aa  233  9e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00130668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3731  rod shape-determining protein MreD  72.22 
 
 		 162 aa  233  9e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000809472  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0458  rod shape-determining protein MreD  72.22 
 
 		 162 aa  233  9e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000615339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3544  rod shape-determining protein MreD  72.22 
 
 		 162 aa  233  9e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0420872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4565  rod shape-determining protein MreD  72.22 
 
 		 162 aa  233  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00217188  normal  0.859989 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3280  rod shape-determining protein MreD  72.22 
 
 		 162 aa  233  9e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000633  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0485  rod shape-determining protein MreD  51.55 
 
 		 163 aa  173  7e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00628066  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2836  rod shape-determining protein MreD  50 
 
 		 162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00169793  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03683  rod shape-determining protein MreD  49.07 
 
 		 162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002385  rod shape-determining protein MreD  49.34 
 
 		 162 aa  161  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.181235  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4400  rod shape-determining protein MreD  42.59 
 
 		 162 aa  153  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.035191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0405  rod shape-determining protein MreD  44.44 
 
 		 162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0933678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0560  rod shape-determining protein MreD  41.98 
 
 		 162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227811  normal  0.273117 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00266  rod shape-determining protein MreD  44.08 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.10714  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3752  rod shape-determining protein MreD  41.98 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0156761  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4096  rod shape-determining protein MreD  41.36 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3646  rod shape-determining protein MreD  40.74 
 
 		 162 aa  142  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.873858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3470  rod shape-determining protein MreD  39.74 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0168845  normal  0.899869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0481  rod shape-determining protein MreD  39.74 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0469  rod shape-determining protein MreD  44.6 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.795079  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0524  rod shape-determining protein MreD  37.04 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101318  normal  0.818556 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3820  rod shape-determining protein MreD  37.04 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0499  rod shape-determining protein MreD  37.04 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000751772  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0520  rod shape-determining protein MreD  37.04 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00293581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0185  rod shape-determining protein MreD  41.06 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.655202  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0576  rod shape-determining protein MreD  37.65 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0136941  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4558  rod shape-determining protein MreD  41.45 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1125  rod shape-determining protein MreD  42.66 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.424224  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3332  rod shape-determining protein MreD  34.97 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.390226  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3736  rod shape-determining protein MreD  34.36 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.284622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0935  rod shape-determining protein MreD  35.19 
 
 		 163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0975  rod shape-determining protein MreD  35.19 
 
 		 162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0942  rod shape-determining protein MreD  34.57 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1124  rod shape-determining protein MreD  42.97 
 
 		 133 aa  111  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.974415  normal  0.147001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1939  rod shape-determining protein MreD  36.91 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0021147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4280  rod shape-determining protein MreD  33.95 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0171  rod shape-determining protein MreD  37.35 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2238  rod shape-determining protein MreD  39.49 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0328  rod shape-determining protein MreD  38.06 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0530008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4161  rod shape-determining protein MreD  34.21 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4470  rod shape-determining protein MreD  33.55 
 
 		 163 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12670  Rod shape-determining protein, MreD  34.39 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58120  rod shape-determining protein MreD  36.84 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1007  rod shape-determining protein MreD  40.12 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0858  rod shape-determining protein MreD  36.18 
 
 		 162 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.930455 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0512  rod shape-determining protein MreD  42.28 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0513  rod shape-determining protein  31.76 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0134717  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1646  rod shape-determining protein MreD  31.76 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897868  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0840  rod shape-determining protein MreD  35.53 
 
 		 163 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5093  rod shape-determining protein MreD  36.18 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0047  rod shape-determining protein MreD  44.17 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.684213  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04260  rod shape-determining protein MreD  33.1 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0102  rod shape-determining protein MreD  31.58 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2726  rod shape-determining protein MreD  28.57 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0795555  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3190  rod shape-determining protein MreD  31.58 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0548619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0589  rod shape-determining protein MreD  35.16 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.305731  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0670  rod shape-determining protein  34.38 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0272534  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2493  rod shape-determining protein MreD  35.65 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.527003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1250  rod shape-determining protein MreD  31.17 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0249622  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3452  rod shape-determining protein MreD  31.97 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.973834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0485  rod shape-determining protein MreD  28.57 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02134 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0318  rod shape-determining protein MreD  28.19 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0422  hypothetical protein  29.25 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000422258  hitchhiker  0.0000312258 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0875  rod shape-determining protein MreD  26.47 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0846  rod shape-determining protein MreD  25 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2564  rod shape-determining protein MreD, putative  22.76 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2194  rod shape-determining protein MreD  22.76 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000732465 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0480  putative rod shape-determining protein MreD  24.83 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00540297  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0053  rod shape-determining protein MreD  26.54 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00417177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0238  rod shape-determining protein MreD  31.18 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4400  rod shape-determining protein MreD  26.85 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0114  rod shape-determining protein MreD  32.08 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0324  rod shape-determining protein MreD  26.85 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0081  putative rod shape-determining MreD transmembrane protein  23.81 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0050  rod shape-determining protein MreD  28.57 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0262  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0078  rod shape-determining MreD transmembrane protein  30.48 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0061  rod shape-determining MRED transmembrane protein  31.17 
 
 		 170 aa  44.3  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.211296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3921  rod shape-determining protein MreD  35.85 
 
 		 176 aa  44.3  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0224  putative rod shape-determining MreD transmembrane protein  30.77 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3365  rod shape-determining protein MreD  24.68 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1740  rod shape-determining protein MreD  25.4 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0144  rod shape-determining protein MreD  33.33 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.825294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>