111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0224 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0224  putative rod shape-determining MreD transmembrane protein  100 
 
 		 172 aa  333  5.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0175  rod shape-determining protein MreD  83.14 
 
 		 172 aa  273  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0285  rod shape-determining protein MreD  67.05 
 
 		 173 aa  241  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0081  putative rod shape-determining MreD transmembrane protein  69.36 
 
 		 173 aa  239  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3921  rod shape-determining protein MreD  69.32 
 
 		 176 aa  236  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1608  putative rod shape-determining MreD transmembrane protein  68.6 
 
 		 172 aa  212  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.641663  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0296  putative rod shape-determining MreD transmembrane protein  61.63 
 
 		 172 aa  206  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0502  rod shape-determining protein MreD  68.26 
 
 		 168 aa  201  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0053  rod shape-determining protein MreD  55.29 
 
 		 170 aa  197  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00417177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0078  rod shape-determining MreD transmembrane protein  55.29 
 
 		 170 aa  192  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0356  rod shape-determining protein MreD  62.79 
 
 		 172 aa  191  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0050  rod shape-determining protein MreD  57.06 
 
 		 170 aa  190  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3365  rod shape-determining protein MreD  55.29 
 
 		 170 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0324  rod shape-determining protein MreD  55.88 
 
 		 170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4400  rod shape-determining protein MreD  55.88 
 
 		 170 aa  188  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3688  rod shape-determining protein MreD  54.71 
 
 		 170 aa  188  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0241  putative rod shape-determining MreD transmembrane protein  64.74 
 
 		 173 aa  186  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0235  rod shape-determining protein MreD  64.74 
 
 		 173 aa  186  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6463  rod shape-determining protein MreD  54.71 
 
 		 170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0144  rod shape-determining protein MreD  55.29 
 
 		 170 aa  182  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.825294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3167  rod shape-determining protein MreD  54.12 
 
 		 170 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00609809  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3050  rod shape-determining protein MreD  54.12 
 
 		 170 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2498  rod shape-determining protein MreD  54.12 
 
 		 170 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3112  rod shape-determining protein MreD  54.12 
 
 		 170 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.222418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3128  rod shape-determining protein MreD  54.12 
 
 		 170 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0160  rod shape-determining protein MreD  54.71 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2787  rod shape-determining protein MreD  54.71 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2292  rod shape-determining protein MreD  54.71 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2372  rod shape-determining protein MreD  54.71 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341743  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3109  rod shape-determining protein MreD  54.12 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0364  rod shape-determining protein MreD  54.71 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0168  rod shape-determining protein MreD  54.71 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0179  rod shape-determining protein MreD  54.71 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0061  rod shape-determining MRED transmembrane protein  55.88 
 
 		 170 aa  170  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.211296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0114  rod shape-determining protein MreD  45.24 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0238  rod shape-determining protein MreD  43.37 
 
 		 173 aa  134  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2023  rod shape-determining protein MreD  45.4 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0751594  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1740  rod shape-determining protein MreD  44.83 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0318  rod shape-determining protein MreD  40.88 
 
 		 173 aa  114  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2493  rod shape-determining protein MreD  34.42 
 
 		 159 aa  84.3  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.527003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12670  Rod shape-determining protein, MreD  35.66 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0975  rod shape-determining protein MreD  33.11 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0942  rod shape-determining protein MreD  33.11 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0935  rod shape-determining protein MreD  33.11 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1939  rod shape-determining protein MreD  28.48 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0021147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0171  rod shape-determining protein MreD  36.08 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4280  rod shape-determining protein MreD  32.89 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0840  rod shape-determining protein MreD  34.39 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0858  rod shape-determining protein MreD  36.07 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.930455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58120  rod shape-determining protein MreD  34.27 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0102  rod shape-determining protein MreD  33.11 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00266  rod shape-determining protein MreD  31.97 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.10714  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2238  rod shape-determining protein MreD  33.33 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5093  rod shape-determining protein MreD  35.04 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2726  rod shape-determining protein MreD  27.41 
 
 		 158 aa  62  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0795555  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0513  rod shape-determining protein  32.69 
 
 		 162 aa  62  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0134717  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04260  rod shape-determining protein MreD  33.83 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1646  rod shape-determining protein MreD  32.69 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897868  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4470  rod shape-determining protein MreD  32.39 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0469  rod shape-determining protein MreD  28.67 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.795079  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4161  rod shape-determining protein MreD  32.39 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0670  rod shape-determining protein  36.28 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0272534  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0589  rod shape-determining protein MreD  36.28 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.305731  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0262  hypothetical protein  38.95 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0328  rod shape-determining protein MreD  33.77 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0530008  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4096  rod shape-determining protein MreD  27.01 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0185  rod shape-determining protein MreD  35.48 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.655202  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3646  rod shape-determining protein MreD  27.41 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.873858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4400  rod shape-determining protein MreD  27.41 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.035191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1125  rod shape-determining protein MreD  27.7 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.424224  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3470  rod shape-determining protein MreD  28.69 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0168845  normal  0.899869 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0512  rod shape-determining protein MreD  34.48 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0481  rod shape-determining protein MreD  27.59 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0400  rod shape-determining protein MreD  37.18 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.269342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1196  rod shape-determining protein MreD  37.18 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00178529  hitchhiker  0.00199386 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0467  rod shape-determining protein MreD  37.18 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00113622  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3452  rod shape-determining protein MreD  30.77 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.973834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0560  rod shape-determining protein MreD  26.67 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227811  normal  0.273117 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3190  rod shape-determining protein MreD  26.09 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0548619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0576  rod shape-determining protein MreD  32.08 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0136941  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4409  rod shape-determining protein MreD  37.18 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000516669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0405  rod shape-determining protein MreD  31.53 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0933678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1250  rod shape-determining protein MreD  38.46 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0265  rod shape-determining protein MreD  34.62 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3820  rod shape-determining protein MreD  28.57 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3685  rod shape-determining protein MreD  32.91 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00121025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0499  rod shape-determining protein MreD  28.57 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000751772  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0254  rod shape-determining protein MreD  34.62 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0028978  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0520  rod shape-determining protein MreD  28.57 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00293581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0524  rod shape-determining protein MreD  28.57 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101318  normal  0.818556 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3635  rod shape-determining protein MreD  32.91 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148983  hitchhiker  0.00393044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3670  rod shape-determining protein MreD  32.91 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.501294  normal  0.526814 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3564  rod shape-determining protein MreD  32.91 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3732  rod shape-determining protein MreD  32.91 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.391337  normal  0.0778624 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3752  rod shape-determining protein MreD  28.47 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0156761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03108  cell wall structural complex MreBCD transmembrane component MreD  29.27 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00126641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0458  rod shape-determining protein MreD  29.27 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0128703  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0458  rod shape-determining protein MreD  29.27 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000615339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3544  rod shape-determining protein MreD  29.27 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0420872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3280  rod shape-determining protein MreD  29.27 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>