More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3744 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3744  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
271 aa  513  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.96 
 
 
271 aa  290  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112929  normal  0.720106 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.31 
 
 
275 aa  289  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.037184 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.52 
 
 
275 aa  289  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.231444  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.68 
 
 
275 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.46 
 
 
272 aa  249  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00231689  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.13 
 
 
276 aa  247  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.01 
 
 
307 aa  239  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327974  normal  0.201863 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.31 
 
 
272 aa  216  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  0.468541 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.57 
 
 
297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3522  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  45.67 
 
 
292 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0898094  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.28 
 
 
292 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0506043 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.88 
 
 
292 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0419738  normal  0.22955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.37 
 
 
291 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3072  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
289 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0415174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0155  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40 
 
 
292 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238601  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
280 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0251  peptide ABC transporter, permease protein  39.55 
 
 
292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5662  ABC transporter membrane spanning protein  42.13 
 
 
291 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
317 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.710446 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
301 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.64 
 
 
287 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.21 
 
 
280 aa  175  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.683345  normal  0.202635 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1497  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  43.63 
 
 
316 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.36992  hitchhiker  0.00105535 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16210  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.87 
 
 
278 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.509076  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.47 
 
 
288 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.228 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.28 
 
 
299 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.730793  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.37 
 
 
316 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.750919 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.25 
 
 
288 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1924  peptide ABC transporter permease  41.38 
 
 
284 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.84 
 
 
265 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.61 
 
 
290 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.411032 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16510  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.02 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.69344 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.38 
 
 
274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
301 aa  162  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
280 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0951  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
275 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24114  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1972  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  37.04 
 
 
262 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000233159  normal  0.641101 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
310 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
301 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
288 aa  156  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0996519  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
299 aa  155  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 
283 aa  155  9e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.78 
 
 
292 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
308 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
299 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
312 aa  153  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
305 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429723  normal  0.768739 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  37.55 
 
 
303 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
274 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
293 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
286 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
284 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.317489  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2030  ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 
300 aa  149  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.749678 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
303 aa  149  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
274 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.120165  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  37.55 
 
 
303 aa  149  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  37.55 
 
 
303 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  37.55 
 
 
303 aa  149  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  33.6 
 
 
299 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  37.55 
 
 
303 aa  149  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.14 
 
 
303 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
303 aa  149  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  33.6 
 
 
299 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  33.6 
 
 
299 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  33.6 
 
 
299 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  37.14 
 
 
303 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  33.6 
 
 
299 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
280 aa  148  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0892  glutathione transport system permease protein GsiD  36.33 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1002  glutathione transport system permease GsiD  36.33 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0952  glutathione transport system permease GsiD  36.33 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.75 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0981  glutathione transport system permease GsiD  36.33 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.0365301 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0919  glutathione transport system permease protein GsiD  36.33 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.285756  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7518  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  34.9 
 
 
295 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0791708  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1924  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.27 
 
 
303 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0805  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppC  36.82 
 
 
300 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
300 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.342595  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
308 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
301 aa  146  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.34 
 
 
293 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.34 
 
 
318 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613574  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
289 aa  145  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109416  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
299 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2574  peptide ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 
302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339829  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275681  normal  0.0822975 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
302 aa  145  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171582  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0370  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  36.5 
 
 
284 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>