More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16210 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_16210  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  100 
 
 
278 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.509076  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52 
 
 
280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726718  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.19 
 
 
275 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.20415  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.24 
 
 
283 aa  185  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.43 
 
 
265 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
307 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327974  normal  0.201863 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
275 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.231444  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3715  peptide ABC transporter membrane protein  37.91 
 
 
290 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0951  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 
275 aa  168  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24114  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
291 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112929  normal  0.720106 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 
275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.037184 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  39.6 
 
 
867 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
275 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
287 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16510  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.34 
 
 
321 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.69344 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
304 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.581816  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.34 
 
 
297 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.33 
 
 
301 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 
299 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530376  normal  0.0228054 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.41 
 
 
299 aa  155  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.730793  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
287 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.37 
 
 
272 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  0.468541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
289 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109416  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
288 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.836901  decreased coverage  0.000740556 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  33.21 
 
 
299 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  33.21 
 
 
299 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  33.21 
 
 
299 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  33.21 
 
 
299 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 
287 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  33.21 
 
 
299 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.81 
 
 
284 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.317489  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  34.8 
 
 
301 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.03 
 
 
285 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
299 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0155  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.06 
 
 
292 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238601  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0788  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, innermembrane subunit  38.81 
 
 
292 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8311  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  35.47 
 
 
285 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
300 aa  149  7e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0620007  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
311 aa  148  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.270364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
305 aa  148  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2107  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.05 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0222662  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0251  peptide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.47 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0323397 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00231689  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.903953  hitchhiker  0.00389411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0805  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppC  36.26 
 
 
300 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 
294 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
300 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.342595  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
296 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528706  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3744  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.6 
 
 
271 aa  146  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1924  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.65 
 
 
303 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0223  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.43 
 
 
295 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 
271 aa  145  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58374  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
300 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1030  nickel transporter permease NikC  38.43 
 
 
270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.503674  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
305 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58779  normal  0.456296 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.44 
 
 
303 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
295 aa  145  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
303 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
300 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  36.12 
 
 
288 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5301  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  35.04 
 
 
296 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.527833  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
273 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.609485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2053  peptide ABC transporter permease  36.82 
 
 
303 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.942235  normal  0.455607 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
296 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
313 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0755  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
291 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0593743  normal  0.296521 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.81 
 
 
303 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
303 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  34.81 
 
 
303 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
303 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
288 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0996519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
284 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
276 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.44 
 
 
303 aa  142  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0952  glutathione transport system permease GsiD  35.66 
 
 
303 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
303 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.44 
 
 
303 aa  143  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
285 aa  142  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.44 
 
 
303 aa  143  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0892  glutathione transport system permease protein GsiD  35.66 
 
 
303 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0981  glutathione transport system permease GsiD  35.66 
 
 
303 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.44 
 
 
303 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0919  glutathione transport system permease protein GsiD  35.66 
 
 
303 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.285756  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1002  glutathione transport system permease GsiD  35.66 
 
 
303 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
300 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
359 aa  142  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.61209  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  35.11 
 
 
300 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.82 
 
 
302 aa  142  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  35.88 
 
 
300 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
307 aa  142  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
300 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>