More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3712 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3712  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 426 aa  868    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.611147  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  64.35 
 
 		 434 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3135  serine hydroxymethyltransferase  64.91 
 
 		 434 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1142  serine hydroxymethyltransferase  64.91 
 
 		 434 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  62.08 
 
 		 439 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4508  serine hydroxymethyltransferase  62.47 
 
 		 412 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.732205 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 438 aa  514  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 		 437 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 		 438 aa  512  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  58.82 
 
 		 434 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  58.82 
 
 		 434 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  61.02 
 
 		 427 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  58.12 
 
 		 434 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  60.28 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 		 434 aa  500  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  58.55 
 
 		 430 aa  500  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  59.42 
 
 		 431 aa  498  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  57.68 
 
 		 434 aa  495  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0692  serine hydroxymethyltransferase  55.96 
 
 		 421 aa  498  1e-139  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.414357  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  57.97 
 
 		 432 aa  495  1e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  57.63 
 
 		 438 aa  492  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  57.93 
 
 		 433 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  58.89 
 
 		 440 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  57.93 
 
 		 433 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 		 432 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  58.75 
 
 		 429 aa  491  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 425 aa  490  1e-137  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  58.35 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  57.97 
 
 		 432 aa  490  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  58.6 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  57.38 
 
 		 432 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2123  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 432 aa  490  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.607283  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 424 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  55.96 
 
 		 413 aa  491  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  58.78 
 
 		 435 aa  488  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  58.35 
 
 		 431 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  62.23 
 
 		 420 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3047  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302237  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5297  serine hydroxymethyltransferase  58.81 
 
 		 433 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  58.49 
 
 		 424 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  58.02 
 
 		 429 aa  482  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  58.17 
 
 		 432 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3404  serine hydroxymethyltransferase  58.81 
 
 		 433 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3104  serine hydroxymethyltransferase  59.13 
 
 		 433 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425727  decreased coverage  0.00549191 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  58.15 
 
 		 412 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  57.91 
 
 		 411 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  58.25 
 
 		 431 aa  478  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  57.63 
 
 		 436 aa  481  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  56.9 
 
 		 431 aa  479  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4276  glycine hydroxymethyltransferase  58.84 
 
 		 451 aa  480  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.514948  normal  0.0110039 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  54.48 
 
 		 422 aa  475  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1727  serine hydroxymethyltransferase  58.84 
 
 		 433 aa  473  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0311  serine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 420 aa  473  1e-132  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  58.11 
 
 		 434 aa  471  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  56.66 
 
 		 431 aa  474  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  53.86 
 
 		 424 aa  472  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 414 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4822  serine hydroxymethyltransferase  55.9 
 
 		 424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 413 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  55.96 
 
 		 415 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  56.32 
 
 		 416 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0870  glycine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 424 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  56.39 
 
 		 427 aa  471  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1131  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 		 438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  54.61 
 
 		 412 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 413 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0055  serine hydroxymethyltransferase  55.18 
 
 		 424 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0828  serine hydroxymethyltransferase  56.14 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0952  serine hydroxymethyltransferase  56.5 
 
 		 435 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  55.01 
 
 		 411 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  54.99 
 
 		 415 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2106  serine hydroxymethyltransferase  56.14 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000232  serine hydroxymethyltransferase  56.29 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  56.62 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 413 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1868  serine hydroxymethyltransferase  55.9 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 413 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0740  serine hydroxymethyltransferase  56.14 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  54.77 
 
 		 411 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3546  serine hydroxymethyltransferase  55.66 
 
 		 424 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  54.99 
 
 		 415 aa  463  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0471  serine hydroxymethyltransferase  55.9 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 413 aa  463  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1979  serine hydroxymethyltransferase  55.9 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00954911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  57.93 
 
 		 416 aa  462  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4649  serine hydroxymethyltransferase  56.4 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.863224  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0710  serine hydroxymethyltransferase  55.9 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1585  serine hydroxymethyltransferase  54.9 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3303  serine hydroxymethyltransferase  54.46 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 		 431 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1006  serine hydroxymethyltransferase  55.9 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05971  serine hydroxymethyltransferase  55.82 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  54.61 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  54.74 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>