221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0909 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0909  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 150 aa  303  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  52.82 
 
 		 425 aa  155  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  51.97 
 
 		 396 aa  140  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  50 
 
 		 397 aa  137  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1856  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.51 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.177717  normal  0.121417 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3323  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.53 
 
 		 142 aa  120  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  45.6 
 
 		 393 aa  111  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.58 
 
 		 402 aa  108  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  46.4 
 
 		 391 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.8 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.27 
 
 		 125 aa  104  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  37.3 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.69 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  44 
 
 		 392 aa  103  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.01 
 
 		 393 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.01 
 
 		 393 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.28 
 
 		 132 aa  103  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.01 
 
 		 393 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.01 
 
 		 393 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2190  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.9 
 
 		 133 aa  103  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.35 
 
 		 134 aa  103  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.22 
 
 		 393 aa  103  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.26 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  44.26 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.26 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.26 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.26 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.26 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.94 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.94 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.26 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.46 
 
 		 393 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.94 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  42.28 
 
 		 396 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.44 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.44 
 
 		 128 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.44 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.44 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.44 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  43.85 
 
 		 390 aa  101  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  41.94 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.44 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.13 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.44 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.62 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.2 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.62 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  42.62 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.74 
 
 		 129 aa  98.6  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4074  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.64 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  40.32 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.13 
 
 		 130 aa  96.7  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  40.77 
 
 		 136 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2049  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.09 
 
 		 133 aa  96.7  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0437123  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.32 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  43.9 
 
 		 386 aa  96.3  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.46 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2692  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.73 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00273056  normal  0.231258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  35.43 
 
 		 373 aa  95.5  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.46 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.35 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.71 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  38.71 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02910  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.8 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  39.84 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.43 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1473  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.44 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.39 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.35 
 
 		 134 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1965  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0644561  normal  0.179898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2687  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.68 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.22317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.92 
 
 		 126 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2282  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.88 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175309  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0830  carboxymuconolactone decarboxylase  34.92 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.21 
 
 		 400 aa  87.4  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3404  carboxymuconolactone decarboxylase  35.92 
 
 		 134 aa  87  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01252  conserved hypothetical protein  36.22 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4207  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.75 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  34.13 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  46.72 
 
 		 397 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.76 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6127  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.441447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  44.55 
 
 		 393 aa  84  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3442  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.52 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2960  carboxymuconolactone decarboxylase  35.65 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00839552  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  35.65 
 
 		 129 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  41.53 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  35.65 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  37.61 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0644  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.22 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0606  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.22 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1912  carboxymuconolactone decarboxylase  36.8 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.955365  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4288  carboxymuconolactone decarboxylase  40.71 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.285381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3726  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.88 
 
 		 127 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  36.97 
 
 		 389 aa  80.1  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3492  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196165  normal  0.332328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>