251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4288 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4288  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 127 aa  254  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.285381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  47.62 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.41 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  45.31 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.41 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.31 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.31 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.65 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.31 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.53 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.53 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.53 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.75 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.53 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5508  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.44 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984625 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.75 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.75 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.75 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.75 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  46.49 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.61 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02910  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.37 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.97 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  49.17 
 
 		 390 aa  99.4  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  46.67 
 
 		 392 aa  99.4  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  44.25 
 
 		 373 aa  98.2  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2527  carboxymuconolactone decarboxylase  44.17 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  39.02 
 
 		 129 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  39.02 
 
 		 129 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  43.24 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45 
 
 		 393 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45 
 
 		 393 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45 
 
 		 393 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  43.24 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45 
 
 		 393 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45 
 
 		 393 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45 
 
 		 393 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  39.02 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3442  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.82 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3235  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.82 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.96 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.34 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  49.06 
 
 		 391 aa  94.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1965  carboxymuconolactone decarboxylase  37.1 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0644561  normal  0.179898 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.38 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  37.4 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.34 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.24 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  44.17 
 
 		 396 aa  94  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.34 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.34 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  41.32 
 
 		 132 aa  94  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.17 
 
 		 402 aa  93.6  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2190  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.05 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.5 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.09 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0830  carboxymuconolactone decarboxylase  41.23 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  38.71 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.34 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  40.52 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.88 
 
 		 161 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.53 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  44.04 
 
 		 127 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.1 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4207  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.13 
 
 		 135 aa  88.6  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  45.37 
 
 		 397 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.1 
 
 		 128 aa  88.2  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.52 
 
 		 123 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2687  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.25 
 
 		 140 aa  87.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.22317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  42.15 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  45.28 
 
 		 393 aa  87.4  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1912  carboxymuconolactone decarboxylase  43.75 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.955365  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4188  carboxymuconolactone decarboxylase  40.83 
 
 		 152 aa  87  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.412642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1473  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.12 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3646  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 		 128 aa  86.7  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3492  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.14 
 
 		 143 aa  86.7  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196165  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.2 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  42.73 
 
 		 393 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.59 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2960  carboxymuconolactone decarboxylase  39.81 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00839552  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.17 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.17 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.95 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4821  carboxymuconolactone decarboxylase  41.96 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0925911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.89 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.441447 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6127  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.28 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4074  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.52 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  41.28 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  37.61 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2049  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.4 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0437123  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.66 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  38.94 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.96 
 
 		 127 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.13 
 
 		 129 aa  83.6  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1326  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.67 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>