More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4808 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4808  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 338 aa  689    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782631 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4612  transcriptional regulator, GntR family  57.06 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3237  transcriptional regulator, GntR family  47.18 
 
 		 365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3881  regulatory protein GntR HTH  44.78 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4217  regulatory protein GntR, HTH  42.94 
 
 		 346 aa  277  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.53296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0954  transcriptional regulator, GntR family  41.79 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5298  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 342 aa  225  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.278192  normal  0.0567929 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3120  regulatory protein GntR HTH  36.18 
 
 		 337 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.109016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1116  regulatory protein GntR, HTH  36.39 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1999  regulatory protein GntR, HTH  34.53 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3597  regulatory protein GntR HTH  35.58 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.848461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5644  regulatory protein GntR HTH  30.15 
 
 		 352 aa  156  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.961176  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 482 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  38.16 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  45.07 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3766  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 248 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  39.19 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  45.07 
 
 		 482 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  45.07 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  40.26 
 
 		 478 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4822  transcriptional regulator, GntR family  39.53 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3995  putative GntR-family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.963661 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4011  putative GntR-family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4116  putative GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4066  putative GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.980684 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  43.66 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  43.66 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1099  histidine utilization repressor  30.23 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 120 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 259 aa  58.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 128 aa  58.9  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  34.72 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3402  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.86 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000368024  hitchhiker  0.000012724 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1192  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 245 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4874  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 92 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2160  putative transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 164 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 280 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 240 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  28.42 
 
 		 245 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1062  MocR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 473 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  36 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1076  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0019673 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 139 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 139 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 139 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 139 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 139 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 139 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  29.87 
 
 		 139 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 139 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 139 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2408  histidine utilization repressor  43.06 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.067403  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02430  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  34.62 
 
 		 478 aa  55.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 139 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1803  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 123 aa  55.8  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 139 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1409  transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 252 aa  55.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2188  histidine utilization repressor  28.68 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5906  histidine utilization repressor  28.68 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 129 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  34.09 
 
 		 252 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2171  histidine utilization repressor  28.68 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.39027  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  36.9 
 
 		 246 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 249 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0763  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 		 242 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 126 aa  53.9  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  31.87 
 
 		 239 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 129 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  31.87 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  31.87 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  34.57 
 
 		 121 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  31.87 
 
 		 239 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  35.14 
 
 		 122 aa  53.9  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2418  putative transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 247 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  35.06 
 
 		 122 aa  53.9  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  37.84 
 
 		 239 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  31.07 
 
 		 243 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5481  histidine utilization repressor  27.91 
 
 		 231 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 		 252 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  32.91 
 
 		 121 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  36.99 
 
 		 463 aa  53.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.67 
 
 		 243 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 133 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 133 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 117 aa  53.1  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>