More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3120 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3120  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 337 aa  696    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.109016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1116  regulatory protein GntR, HTH  41.99 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4612  transcriptional regulator, GntR family  37.8 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4808  transcriptional regulator, GntR family  36.18 
 
 		 338 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3237  transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 		 365 aa  203  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0954  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 338 aa  189  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3881  regulatory protein GntR HTH  32.63 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4217  regulatory protein GntR, HTH  34 
 
 		 346 aa  179  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.53296  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1999  regulatory protein GntR, HTH  31.31 
 
 		 335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3597  regulatory protein GntR HTH  32.92 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.848461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5644  regulatory protein GntR HTH  28.82 
 
 		 352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.961176  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5298  transcriptional regulator, GntR family  26.59 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.278192  normal  0.0567929 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  30.94 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1012  regulatory protein GntR, HTH  24.14 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18240  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 160 aa  62.4  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.41291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 128 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  40 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 124 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  38.67 
 
 		 483 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  38.67 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  38.67 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  38.67 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  38.1 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 137 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 146 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  32.22 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4866  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 134 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251878 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  34.21 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 121 aa  57.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  38.46 
 
 		 126 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 489 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 117 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 128 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0882  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 134 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 123 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 123 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4240  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.66 
 
 		 517 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 130 aa  57.4  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0208  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 466 aa  56.2  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5004  transcriptional regulator, GntR family  30.86 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69750  putative transcriptional regulator  32.53 
 
 		 458 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.477513  normal  0.557474 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  43.75 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  34.18 
 
 		 121 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  36 
 
 		 476 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 287 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  36.14 
 
 		 129 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 138 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3314  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.73 
 
 		 494 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0868  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 606 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1175  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 468 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1672  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.12 
 
 		 435 aa  55.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 121 aa  55.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1803  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 123 aa  55.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  35.9 
 
 		 124 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 124 aa  55.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 124 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 124 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  37.18 
 
 		 124 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4220  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 498 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0549484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 124 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  37.18 
 
 		 124 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4705  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.49 
 
 		 472 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798058 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  37.18 
 
 		 124 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0191  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 125 aa  54.7  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  34.44 
 
 		 257 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 478 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  37.18 
 
 		 125 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3628  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  30.49 
 
 		 472 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  35.14 
 
 		 493 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 139 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  34.44 
 
 		 257 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 139 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 139 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 139 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 139 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 507 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5165  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 469 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.469019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 249 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 480 aa  54.3  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 139 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 130 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 507 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 139 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 520 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 507 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4072  GntR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 458 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>