More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4220 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4220  transcriptional regulator  100 
 
 
498 aa  1031    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0549484  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3329  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
515 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.895754  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3030  transcriptional regulator  36.97 
 
 
537 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  34.42 
 
 
508 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  36.19 
 
 
504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.72 
 
 
465 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 
491 aa  233  8.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
490 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.44 
 
 
488 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.67 
 
 
488 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.55 
 
 
474 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
504 aa  221  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.14 
 
 
500 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  32.15 
 
 
480 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.38 
 
 
472 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 
517 aa  216  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
492 aa  216  9e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.99 
 
 
481 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1064  transcriptional regulator  30.91 
 
 
477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  33.76 
 
 
476 aa  214  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
504 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0497  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
463 aa  212  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 
496 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  34.77 
 
 
494 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
502 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
494 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  34.72 
 
 
502 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
502 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
494 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2363  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
459 aa  210  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  31.41 
 
 
463 aa  210  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  31.67 
 
 
510 aa  211  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  32.01 
 
 
494 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  33.79 
 
 
478 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.14 
 
 
471 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 
471 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  31.58 
 
 
509 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  31.92 
 
 
503 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4350  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.67 
 
 
509 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  30.75 
 
 
520 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
497 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 
494 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.95 
 
 
497 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
470 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
488 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
480 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  35.29 
 
 
498 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  31.45 
 
 
463 aa  206  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.01 
 
 
485 aa  206  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  32.08 
 
 
509 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
505 aa  206  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  32.06 
 
 
501 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  30.56 
 
 
497 aa  205  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.05 
 
 
495 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  32.12 
 
 
502 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  30.35 
 
 
489 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  33.02 
 
 
495 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.09 
 
 
501 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
502 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.07 
 
 
501 aa  203  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  33.26 
 
 
509 aa  203  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
475 aa  203  7e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.06 
 
 
485 aa  202  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
574 aa  202  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.32 
 
 
486 aa  202  9e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
569 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  31.22 
 
 
516 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1588  GntR family transcriptional regulator  30.31 
 
 
485 aa  202  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104897  hitchhiker  0.00377444 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
484 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  31.95 
 
 
471 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  33.85 
 
 
502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.65 
 
 
507 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
516 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
492 aa  200  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
502 aa  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
501 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
502 aa  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  34.01 
 
 
523 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
562 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
546 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.64 
 
 
491 aa  199  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
564 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  32.75 
 
 
561 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
564 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
503 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
507 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  27.66 
 
 
470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  33.03 
 
 
564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.85 
 
 
472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
490 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
473 aa  197  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  33.4 
 
 
476 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
507 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 
466 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>