More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1962 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1962  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 398 aa  816    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.98041 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1873  Homoserine dehydrogenase  52.45 
 
 		 413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000161623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  34.71 
 
 		 442 aa  223  7e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  37.19 
 
 		 430 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  39.55 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  38.99 
 
 		 429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  37.92 
 
 		 441 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  37.46 
 
 		 424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  36.66 
 
 		 440 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  37.19 
 
 		 431 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  37.19 
 
 		 431 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  37.19 
 
 		 431 aa  213  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  35.93 
 
 		 431 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  35.93 
 
 		 431 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  36.88 
 
 		 431 aa  210  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  36.88 
 
 		 431 aa  210  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  36.88 
 
 		 431 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  36.25 
 
 		 430 aa  209  6e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  37.07 
 
 		 431 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  37.07 
 
 		 431 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  37.07 
 
 		 431 aa  208  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 431 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  38.73 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  36.76 
 
 		 417 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  36.76 
 
 		 431 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  36.76 
 
 		 417 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  36.76 
 
 		 431 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  36.76 
 
 		 431 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  36.76 
 
 		 431 aa  206  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0897  homoserine dehydrogenase  39.3 
 
 		 426 aa  206  7e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000316275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  36.56 
 
 		 431 aa  206  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  36.76 
 
 		 431 aa  206  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 431 aa  205  9e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  36.56 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  33.88 
 
 		 438 aa  205  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  39.17 
 
 		 426 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  36.94 
 
 		 443 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  39.17 
 
 		 426 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  36.62 
 
 		 443 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  34.71 
 
 		 442 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  35.26 
 
 		 442 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  34.71 
 
 		 442 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  34.44 
 
 		 442 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1075  homoserine dehydrogenase  32.52 
 
 		 408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000110066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  36.98 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  34.71 
 
 		 442 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  34.58 
 
 		 442 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  38.26 
 
 		 423 aa  199  6e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  36.94 
 
 		 442 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  38.36 
 
 		 441 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  33.05 
 
 		 439 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  37.04 
 
 		 441 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  36.42 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1452  homoserine dehydrogenase  36.22 
 
 		 414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0556341  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  38.36 
 
 		 441 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  35.2 
 
 		 429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  35.49 
 
 		 432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  35.31 
 
 		 441 aa  197  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  36.42 
 
 		 430 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3603  homoserine dehydrogenase  36.01 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021314  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  36.31 
 
 		 443 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  35.78 
 
 		 438 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  35.31 
 
 		 424 aa  196  9e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2310  Homoserine dehydrogenase  38.36 
 
 		 441 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  31.55 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  33.98 
 
 		 427 aa  194  2e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  31.84 
 
 		 436 aa  193  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  39.49 
 
 		 432 aa  193  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  34.81 
 
 		 448 aa  193  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48694  predicted protein  37.3 
 
 		 437 aa  193  5e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203974  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1062  homoserine dehydrogenase  37.38 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  37.38 
 
 		 428 aa  191  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  36.45 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  36.01 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  36.11 
 
 		 432 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  34.69 
 
 		 435 aa  189  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  37.18 
 
 		 428 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11571  homoserine dehydrogenase  34.71 
 
 		 433 aa  189  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.292612  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11561  homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 433 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  35.46 
 
 		 437 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  35.46 
 
 		 437 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0975  homoserine dehydrogenase  31.76 
 
 		 430 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000487265  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  35.9 
 
 		 437 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  34.96 
 
 		 417 aa  187  4e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1376  homoserine dehydrogenase  36.18 
 
 		 415 aa  187  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372588  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  33.94 
 
 		 440 aa  186  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  35.37 
 
 		 436 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  34.82 
 
 		 449 aa  186  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  37.3 
 
 		 436 aa  186  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  34.19 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  36.62 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3015  Homoserine dehydrogenase  34.93 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00421083  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  34.46 
 
 		 427 aa  184  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  34.19 
 
 		 439 aa  184  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  32.68 
 
 		 437 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  34.19 
 
 		 439 aa  184  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11421  homoserine dehydrogenase  34.07 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.209412  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  35.74 
 
 		 440 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1016  homoserine dehydrogenase  36.97 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00327317  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  33.14 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>