119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0588 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0588  glycosyl transferase family 39  100 
 
 		 519 aa  1054    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1293  glycosyl transferase family 39  45.52 
 
 		 554 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0756135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4587  glycosyl transferase family 39  43.77 
 
 		 584 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000502234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4199  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 		 601 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.458284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 		 553 aa  88.6  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  24.33 
 
 		 554 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0861  glycosyl transferase family 39  25.21 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00631433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  26.36 
 
 		 553 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  22.86 
 
 		 512 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  27.47 
 
 		 575 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  26.3 
 
 		 528 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  24.56 
 
 		 519 aa  73.9  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 		 514 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  25.05 
 
 		 557 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  25.54 
 
 		 609 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.41 
 
 		 555 aa  69.7  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0797  glycosyl transferase family 39  23.9 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000309537  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  23 
 
 		 527 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  26 
 
 		 561 aa  69.3  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  24.38 
 
 		 535 aa  68.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  24.38 
 
 		 535 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  25.12 
 
 		 601 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  24 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  23.85 
 
 		 520 aa  67.4  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.04 
 
 		 550 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  23.04 
 
 		 550 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.04 
 
 		 550 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.31 
 
 		 550 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  23.04 
 
 		 550 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 		 585 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.04 
 
 		 550 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.04 
 
 		 550 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.04 
 
 		 550 aa  66.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.04 
 
 		 550 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0033  sugar transferase, putative  23.22 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0047  glycosyl transferase family protein  23.22 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247457  hitchhiker  0.000148849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0047  glycosyl transferase family protein  23.22 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.243952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0050  glycosyl transferase family protein  23.22 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.127538 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.93 
 
 		 601 aa  63.9  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  26.05 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  21.78 
 
 		 534 aa  62.4  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2541  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.38 
 
 		 548 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  0.550042 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.65 
 
 		 548 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.28 
 
 		 556 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  25.07 
 
 		 601 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.38 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.38 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  23.18 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  22.28 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 		 631 aa  61.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1792  hypothetical protein  21.93 
 
 		 564 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.018276 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  22.16 
 
 		 541 aa  60.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0731  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 		 477 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  24.17 
 
 		 515 aa  59.7  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  21.01 
 
 		 550 aa  58.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  22.52 
 
 		 565 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2486  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.1 
 
 		 548 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0725  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 		 609 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0287  glycosyl transferase family protein  24.87 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3628  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  22.16 
 
 		 612 aa  57.4  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.92 
 
 		 554 aa  57  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.92 
 
 		 554 aa  57  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  22.53 
 
 		 575 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0714  hypothetical protein  24.46 
 
 		 464 aa  56.6  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157083 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.92 
 
 		 554 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1321  glycosyl transferase family 39  22.86 
 
 		 541 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  22.22 
 
 		 611 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  24.86 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.22 
 
 		 546 aa  55.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1409  glycosyl transferase family protein  23.66 
 
 		 584 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  24.37 
 
 		 522 aa  53.9  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  22.94 
 
 		 564 aa  53.9  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  21.89 
 
 		 612 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4300  glycosyl transferase family 39  25.23 
 
 		 551 aa  53.5  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  21.67 
 
 		 516 aa  52.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  23.26 
 
 		 559 aa  52.4  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  22.77 
 
 		 605 aa  52.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  24.61 
 
 		 556 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2697  glycosyl transferase family protein  23.43 
 
 		 493 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0933848  normal  0.158147 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  23.55 
 
 		 573 aa  52  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.04 
 
 		 549 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  25.26 
 
 		 514 aa  50.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  23.34 
 
 		 563 aa  50.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  23.34 
 
 		 563 aa  50.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.21 
 
 		 569 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  23.3 
 
 		 556 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.75 
 
 		 556 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.01 
 
 		 553 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  21.91 
 
 		 563 aa  49.3  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0137  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  23.91 
 
 		 478 aa  48.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234372  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1778  hypothetical protein  25.15 
 
 		 596 aa  48.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0126  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  23.91 
 
 		 477 aa  48.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0482  glycosyl transferase family 39  24.19 
 
 		 554 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 		 600 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1864  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25 
 
 		 479 aa  47.4  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.516095  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  23.24 
 
 		 553 aa  47.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0380  glycosyl transferase family protein  23.31 
 
 		 570 aa  47.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3950  glycosyl transferase family 39  22.72 
 
 		 540 aa  47  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131348 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  23.46 
 
 		 568 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>