135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1293 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1293  glycosyl transferase family 39  100 
 
 
554 aa  1127    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0756135  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4587  glycosyl transferase family 39  43.48 
 
 
584 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000502234  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0588  glycosyl transferase family 39  45.52 
 
 
519 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4199  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 
601 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.458284  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  24.4 
 
 
541 aa  87.8  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 
554 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  24.58 
 
 
575 aa  83.6  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  22.87 
 
 
553 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 
586 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  27.1 
 
 
575 aa  82  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  23.69 
 
 
565 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  22.76 
 
 
553 aa  77  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4587  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  22.38 
 
 
580 aa  75.5  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.467811  hitchhiker  0.00235172 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2518  glycosyl transferase family 39  22.9 
 
 
530 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3588  glycosyl transferase family 39  22.9 
 
 
530 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.196881  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  23.53 
 
 
535 aa  73.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  23.53 
 
 
535 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4300  glycosyl transferase family 39  26.16 
 
 
551 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03137  hypothetical protein  25.38 
 
 
551 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445477  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.75 
 
 
569 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 
600 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  22.53 
 
 
573 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  20.25 
 
 
564 aa  70.1  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  22.22 
 
 
561 aa  68.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 
585 aa  68.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  22.81 
 
 
563 aa  68.2  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  23.13 
 
 
557 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  21.47 
 
 
611 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.92 
 
 
548 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.92 
 
 
548 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  24.46 
 
 
519 aa  65.9  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  22.09 
 
 
520 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.92 
 
 
548 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  25.07 
 
 
558 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2486  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.92 
 
 
548 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2541  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.61 
 
 
548 aa  64.7  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  0.550042 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 
558 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  22.19 
 
 
601 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  23.19 
 
 
578 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1324  hypothetical protein  23.97 
 
 
556 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.127825  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.41 
 
 
549 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
522 aa  62.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  22.19 
 
 
568 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1976  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
541 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.167644  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  22.19 
 
 
553 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  25.16 
 
 
556 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
558 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  22.19 
 
 
576 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  22.19 
 
 
576 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  22.19 
 
 
576 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  22.19 
 
 
568 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  22.19 
 
 
576 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  22.96 
 
 
512 aa  60.8  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  23.71 
 
 
558 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2555  melittin resistance protein, putative  25.91 
 
 
537 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3370  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
582 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0479028  normal  0.0785337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  24.92 
 
 
556 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  21.97 
 
 
585 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  19.72 
 
 
534 aa  58.9  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0725  glycosyl transferase family protein  23.91 
 
 
609 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  24.01 
 
 
613 aa  57.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  21.82 
 
 
550 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  21.52 
 
 
550 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  21.52 
 
 
550 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  21.52 
 
 
550 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  21.52 
 
 
550 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  21.52 
 
 
550 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  21.82 
 
 
550 aa  57  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2693  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.19 
 
 
550 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421151  normal  0.435819 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  21.52 
 
 
550 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  21.52 
 
 
550 aa  55.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  22.3 
 
 
527 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0482  glycosyl transferase family 39  22.84 
 
 
554 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6222  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 
558 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1857  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 
558 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.894443  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1881  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 
558 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300143  hitchhiker  0.00000511252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1589  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.41 
 
 
549 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  21.45 
 
 
555 aa  54.7  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0033  sugar transferase, putative  22.58 
 
 
484 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  25.48 
 
 
515 aa  54.3  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0047  glycosyl transferase family protein  22.58 
 
 
484 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247457  hitchhiker  0.000148849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0047  glycosyl transferase family protein  22.58 
 
 
484 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.243952  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0050  glycosyl transferase family protein  22.58 
 
 
484 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.127538 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  22.69 
 
 
323 aa  54.3  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  21.8 
 
 
554 aa  54.3  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  21.8 
 
 
554 aa  54.3  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1864  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.43 
 
 
479 aa  53.9  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.516095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  21.8 
 
 
554 aa  53.9  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18330  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.29 
 
 
549 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0521799  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16111  hypothetical protein  30 
 
 
535 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04058  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase  29.21 
 
 
573 aa  52.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0137  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.87 
 
 
478 aa  51.6  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0731  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 
477 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  23.73 
 
 
563 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0126  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.87 
 
 
477 aa  51.6  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  23.73 
 
 
563 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  23.11 
 
 
559 aa  51.6  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  22.37 
 
 
514 aa  51.6  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0287  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
515 aa  51.6  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0689  hypothetical protein  22.95 
 
 
493 aa  51.2  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>