137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4587 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4587  glycosyl transferase family 39  100 
 
 		 584 aa  1179    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000502234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1293  glycosyl transferase family 39  43.65 
 
 		 554 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0756135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0588  glycosyl transferase family 39  43.77 
 
 		 519 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4199  glycosyl transferase family protein  30.02 
 
 		 601 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.458284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  25.8 
 
 		 554 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  26.87 
 
 		 519 aa  78.2  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  24.3 
 
 		 565 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  25.3 
 
 		 553 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  24.93 
 
 		 527 aa  75.5  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  25.66 
 
 		 575 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  24.86 
 
 		 573 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  23.51 
 
 		 553 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 		 564 aa  71.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  23.68 
 
 		 528 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0033  sugar transferase, putative  24.64 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0047  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247457  hitchhiker  0.000148849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0047  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.243952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0050  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.127538 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  22.22 
 
 		 534 aa  67.8  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  23.96 
 
 		 520 aa  68.2  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  23.55 
 
 		 575 aa  67.8  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3588  glycosyl transferase family 39  25.99 
 
 		 530 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.196881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  25.42 
 
 		 563 aa  62.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2518  glycosyl transferase family 39  25.99 
 
 		 530 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  24.73 
 
 		 578 aa  62  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  23.4 
 
 		 514 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  22.99 
 
 		 586 aa  60.8  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  23.78 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  24.04 
 
 		 557 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 		 558 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  22.87 
 
 		 534 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3551  glycosyl transferase family protein  22.8 
 
 		 547 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141392  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  25.48 
 
 		 515 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  25.8 
 
 		 600 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.64 
 
 		 549 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.93 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4300  glycosyl transferase family 39  23.65 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03137  hypothetical protein  23.99 
 
 		 551 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.96 
 
 		 601 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.93 
 
 		 553 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 558 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 		 558 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0725  glycosyl transferase family protein  24.93 
 
 		 609 aa  57  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  23.87 
 
 		 585 aa  57  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.64 
 
 		 576 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  23.16 
 
 		 622 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  23.34 
 
 		 535 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0287  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 		 515 aa  57  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.64 
 
 		 576 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.64 
 
 		 576 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.64 
 
 		 568 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.64 
 
 		 576 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.39 
 
 		 550 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  23.16 
 
 		 622 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  24.01 
 
 		 556 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  23.34 
 
 		 535 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  21.77 
 
 		 541 aa  56.2  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.74 
 
 		 553 aa  56.2  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04058  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase  25.96 
 
 		 573 aa  56.2  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.12 
 
 		 550 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  24.12 
 
 		 550 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  24.55 
 
 		 556 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 		 613 aa  55.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.12 
 
 		 550 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  24.12 
 
 		 550 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.12 
 
 		 550 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.12 
 
 		 550 aa  55.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  22.95 
 
 		 323 aa  55.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1864  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.32 
 
 		 479 aa  55.1  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.516095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2544  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 		 581 aa  55.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.327974  normal  0.26724 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.12 
 
 		 550 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  22.1 
 
 		 515 aa  54.7  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.12 
 
 		 550 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  20.65 
 
 		 516 aa  54.3  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3628  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 479 aa  53.9  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6222  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 558 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1857  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 558 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.894443  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1881  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 558 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300143  hitchhiker  0.00000511252 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1409  glycosyl transferase family protein  24.93 
 
 		 584 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0731  glycosyl transferase family protein  25.34 
 
 		 477 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2076  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 580 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2697  glycosyl transferase family protein  24.13 
 
 		 493 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0933848  normal  0.158147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.77 
 
 		 569 aa  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 		 666 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2836  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 		 509 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3121  glycosyl transferase family 39  28.16 
 
 		 577 aa  51.2  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1324  hypothetical protein  23.85 
 
 		 556 aa  51.2  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1533  glycosyl transferase family protein  27 
 
 		 584 aa  50.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.030992  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4587  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  22.77 
 
 		 580 aa  50.4  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.467811  hitchhiker  0.00235172 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  33.8 
 
 		 606 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1976  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 		 541 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.167644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3950  glycosyl transferase family 39  25.76 
 
 		 540 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131348 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  22.51 
 
 		 550 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2628  glycosyl transferase family 39  25.9 
 
 		 629 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  23.18 
 
 		 631 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1792  hypothetical protein  31.58 
 
 		 564 aa  49.3  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.018276 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  21.52 
 
 		 522 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1926  hypothetical protein  25.47 
 
 		 565 aa  48.5  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1862  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 		 565 aa  48.5  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>