More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3043 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0723  adenylosuccinate lyase  72.43 
 
 		 475 aa  704    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.291552  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0741  adenylosuccinate lyase  71.27 
 
 		 475 aa  686    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000408437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3043  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 477 aa  990    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1922  adenylosuccinate lyase  64.62 
 
 		 476 aa  674    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1640  adenylosuccinate lyase  64.41 
 
 		 476 aa  673    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1129  adenylosuccinate lyase  62.03 
 
 		 476 aa  643    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1620  adenylosuccinate lyase  60.47 
 
 		 473 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2150  adenylosuccinate lyase  60 
 
 		 479 aa  599  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0326846  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3831  adenylosuccinate lyase  59.28 
 
 		 476 aa  596  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0331  adenylosuccinate lyase  58.11 
 
 		 476 aa  571  1e-161  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18087  adenylosuccinate lyase  56.84 
 
 		 499 aa  558  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03070  adenylosuccinate lyase, putative  55.56 
 
 		 479 aa  531  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.468629  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84718  3-isopropylmalate dehydratase  55.92 
 
 		 483 aa  518  1e-146  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00000783625  normal  0.0902341 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06209  adenylosuccinate lyase (Eurofung)  52.01 
 
 		 489 aa  499  1e-140  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6408  adenylosuccinate lyase  33.26 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0580  adenylosuccinate lyase  32.07 
 
 		 476 aa  240  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194315  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1402  adenylosuccinate lyase  30.85 
 
 		 483 aa  240  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.390874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38040  adenylosuccinate lyase  32.37 
 
 		 476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5145  adenylosuccinate lyase  31.85 
 
 		 491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1613  adenylosuccinate lyase  31.4 
 
 		 481 aa  233  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0154  adenylosuccinate lyase  31.33 
 
 		 474 aa  230  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0147  adenylosuccinate lyase  31.65 
 
 		 474 aa  229  7e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3624  adenylosuccinate lyase  31.22 
 
 		 475 aa  228  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4949  adenylosuccinate lyase  31.94 
 
 		 475 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4654  adenylosuccinate lyase  31.72 
 
 		 475 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4566  adenylosuccinate lyase  31.72 
 
 		 477 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10792  adenylosuccinate lyase  30.29 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.99152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1783  adenylosuccinate lyase  30.82 
 
 		 475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4439  adenylosuccinate lyase ; K01756 adenylosuccinate lyase  30.29 
 
 		 476 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00550594  hitchhiker  0.000234914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6888  adenylosuccinate lyase  30.48 
 
 		 476 aa  220  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5086  adenylosuccinate lyase  30.59 
 
 		 496 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0838  adenylosuccinate lyase  30.89 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2434  adenylosuccinate lyase  30.14 
 
 		 476 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114262  normal  0.241079 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4341  adenylosuccinate lyase  30.11 
 
 		 476 aa  211  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2128  adenylosuccinate lyase  31.77 
 
 		 475 aa  199  7e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1941  adenylosuccinate lyase  27.72 
 
 		 474 aa  194  4e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324214  normal  0.0794487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  32.02 
 
 		 446 aa  192  9e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  30.97 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  31.63 
 
 		 446 aa  187  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  31.47 
 
 		 448 aa  186  9e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  30.99 
 
 		 446 aa  186  9e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  31.49 
 
 		 445 aa  182  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  30.2 
 
 		 445 aa  177  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  29.89 
 
 		 430 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  30.81 
 
 		 438 aa  172  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  28.7 
 
 		 430 aa  170  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  30.3 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  29.34 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  31.3 
 
 		 431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  27.58 
 
 		 451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  27.54 
 
 		 451 aa  166  8e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  29.53 
 
 		 431 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  30.15 
 
 		 430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  27.29 
 
 		 451 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  30.07 
 
 		 448 aa  164  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1351  adenylosuccinate lyase  26.61 
 
 		 448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0804314  normal  0.668608 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  28.66 
 
 		 446 aa  162  9e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  29.33 
 
 		 431 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01290  Adenylosuccinate lyase  26.5 
 
 		 447 aa  161  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  29.24 
 
 		 432 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  29.04 
 
 		 449 aa  160  5e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  28.33 
 
 		 431 aa  160  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  28.96 
 
 		 431 aa  160  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  28.54 
 
 		 431 aa  159  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  28.46 
 
 		 431 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  27.36 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  27.85 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1011  adenylosuccinate lyase  30.12 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1446  adenylosuccinate lyase  29.49 
 
 		 433 aa  159  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000278594  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  28.33 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  28.64 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  29.26 
 
 		 430 aa  157  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  29.07 
 
 		 435 aa  156  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  29.07 
 
 		 435 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  28.93 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1118  adenylosuccinate lyase  29.35 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.984181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  28.93 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  28.82 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  28.82 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00300  Adenylosuccinate lyase  26 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  28.82 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  28.82 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  28.82 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  28.82 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  26.58 
 
 		 432 aa  155  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  27.59 
 
 		 431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  30.3 
 
 		 449 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  26.9 
 
 		 430 aa  153  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  28.57 
 
 		 435 aa  153  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  28.82 
 
 		 435 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  28.32 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1217  adenylosuccinate lyase  27.8 
 
 		 457 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0739358  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  26.21 
 
 		 431 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  26.21 
 
 		 431 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0294  adenylosuccinate lyase  28.42 
 
 		 449 aa  150  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  30.02 
 
 		 431 aa  150  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  29.41 
 
 		 449 aa  150  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  28.98 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0161  adenylosuccinate lyase  32.24 
 
 		 406 aa  147  5e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.576792  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  25.9 
 
 		 432 aa  147  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>