More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5086 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6888  adenylosuccinate lyase  71.49 
 
 		 476 aa  662    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1783  adenylosuccinate lyase  72.03 
 
 		 475 aa  676    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0147  adenylosuccinate lyase  70.13 
 
 		 474 aa  642    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4949  adenylosuccinate lyase  71.37 
 
 		 475 aa  652    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0838  adenylosuccinate lyase  68.86 
 
 		 479 aa  649    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6408  adenylosuccinate lyase  70.97 
 
 		 472 aa  649    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38040  adenylosuccinate lyase  70.49 
 
 		 476 aa  648    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2434  adenylosuccinate lyase  70.97 
 
 		 476 aa  642    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114262  normal  0.241079 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3624  adenylosuccinate lyase  70.23 
 
 		 475 aa  638    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5086  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 496 aa  989    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1613  adenylosuccinate lyase  71.94 
 
 		 481 aa  660    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10792  adenylosuccinate lyase  70.19 
 
 		 472 aa  642    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.99152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4566  adenylosuccinate lyase  71.37 
 
 		 477 aa  653    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0154  adenylosuccinate lyase  69.83 
 
 		 474 aa  650    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4654  adenylosuccinate lyase  71.37 
 
 		 475 aa  653    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5145  adenylosuccinate lyase  70.06 
 
 		 491 aa  654    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4439  adenylosuccinate lyase ; K01756 adenylosuccinate lyase  70.18 
 
 		 476 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00550594  hitchhiker  0.000234914 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4341  adenylosuccinate lyase  67.86 
 
 		 476 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0580  adenylosuccinate lyase  62.71 
 
 		 476 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194315  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2128  adenylosuccinate lyase  61.68 
 
 		 475 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1402  adenylosuccinate lyase  56.99 
 
 		 483 aa  515  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.390874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1941  adenylosuccinate lyase  55.49 
 
 		 474 aa  502  1e-141  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324214  normal  0.0794487 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18087  adenylosuccinate lyase  33.26 
 
 		 499 aa  243  5e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3831  adenylosuccinate lyase  32.18 
 
 		 476 aa  236  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1922  adenylosuccinate lyase  30.8 
 
 		 476 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1640  adenylosuccinate lyase  30.8 
 
 		 476 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1129  adenylosuccinate lyase  31.84 
 
 		 476 aa  231  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84718  3-isopropylmalate dehydratase  33.77 
 
 		 483 aa  229  8e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00000783625  normal  0.0902341 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1620  adenylosuccinate lyase  31 
 
 		 473 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0331  adenylosuccinate lyase  31.17 
 
 		 476 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0723  adenylosuccinate lyase  29.45 
 
 		 475 aa  220  5e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.291552  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0741  adenylosuccinate lyase  29.93 
 
 		 475 aa  209  9e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000408437  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2150  adenylosuccinate lyase  29.69 
 
 		 479 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0326846  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03070  adenylosuccinate lyase, putative  32.68 
 
 		 479 aa  207  5e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.468629  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3043  adenylosuccinate lyase  30.59 
 
 		 477 aa  203  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06209  adenylosuccinate lyase (Eurofung)  30.15 
 
 		 489 aa  197  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01290  Adenylosuccinate lyase  31.21 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00300  Adenylosuccinate lyase  31.47 
 
 		 447 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  33.03 
 
 		 432 aa  166  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  31.41 
 
 		 430 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0256  adenylosuccinate lyase  30.75 
 
 		 461 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  29.11 
 
 		 432 aa  161  3e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  32.58 
 
 		 435 aa  161  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  31.52 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  31.52 
 
 		 434 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  31.67 
 
 		 433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  31.9 
 
 		 433 aa  156  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  31.9 
 
 		 433 aa  156  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  32.15 
 
 		 435 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  31.83 
 
 		 435 aa  156  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  28.97 
 
 		 438 aa  156  9e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  31.04 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  31.28 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  31.74 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  31.75 
 
 		 435 aa  154  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  26.73 
 
 		 451 aa  153  7e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  31.53 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  31.65 
 
 		 435 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  30.35 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  27.59 
 
 		 433 aa  150  5e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  30.2 
 
 		 431 aa  150  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  31.29 
 
 		 435 aa  150  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  26.65 
 
 		 451 aa  150  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  30.68 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  28.32 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  29.66 
 
 		 430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  26.27 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  29.66 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  30.96 
 
 		 430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  29.19 
 
 		 431 aa  149  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  31.03 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  28.51 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3019  adenylosuccinate lyase  31.71 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.472154  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  30.4 
 
 		 450 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  29.07 
 
 		 431 aa  147  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  31.19 
 
 		 445 aa  147  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  28.57 
 
 		 431 aa  147  6e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  29.46 
 
 		 442 aa  146  8.000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0391  adenylosuccinate lyase  29.19 
 
 		 431 aa  146  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000515092 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  31.03 
 
 		 431 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  30.56 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  31.03 
 
 		 431 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1309  adenylosuccinate lyase  29.98 
 
 		 438 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.244408  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1139  adenylosuccinate lyase  28.67 
 
 		 425 aa  144  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.863394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  30.79 
 
 		 431 aa  143  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  30.99 
 
 		 435 aa  143  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  30.24 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  29.9 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  29.69 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  28.51 
 
 		 431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0179  adenylosuccinate lyase  30.39 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0644035  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  28.71 
 
 		 431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  28.5 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1108  adenylosuccinate lyase  28.19 
 
 		 434 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.34197  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  31.68 
 
 		 437 aa  141  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  27.87 
 
 		 430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  31.34 
 
 		 430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3849  adenylosuccinate lyase  30.18 
 
 		 435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  29.82 
 
 		 431 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1068  adenylosuccinate lyase  30.28 
 
 		 438 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0025797  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>