More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00300 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_01290  Adenylosuccinate lyase  80.98 
 
 		 447 aa  773    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00300  Adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 447 aa  930    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0256  adenylosuccinate lyase  85.01 
 
 		 461 aa  795    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1351  adenylosuccinate lyase  68.9 
 
 		 448 aa  654    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0804314  normal  0.668608 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  51.8 
 
 		 431 aa  457  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  50.34 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  49.55 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 431 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  49.55 
 
 		 430 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  49.55 
 
 		 438 aa  440  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  49.55 
 
 		 434 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  51.45 
 
 		 433 aa  438  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  48.65 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  48.87 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  49.1 
 
 		 435 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  48.88 
 
 		 435 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  49.1 
 
 		 435 aa  433  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  49.1 
 
 		 435 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  49.1 
 
 		 435 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  49.1 
 
 		 435 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  51.04 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  48.88 
 
 		 435 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  48.87 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  49.1 
 
 		 435 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  48.21 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  49.1 
 
 		 434 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  49.1 
 
 		 434 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  49.55 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  47.84 
 
 		 434 aa  431  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  48.42 
 
 		 431 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  48.87 
 
 		 430 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  48.21 
 
 		 435 aa  428  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  48.43 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  49.32 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  48.01 
 
 		 438 aa  428  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  50.11 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  49.66 
 
 		 433 aa  428  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  48.42 
 
 		 431 aa  428  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  51.45 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  45.05 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  51.45 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  48.2 
 
 		 450 aa  425  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 		 435 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  48.86 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  47.52 
 
 		 430 aa  418  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  48.99 
 
 		 435 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 		 435 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  49.66 
 
 		 435 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  48.77 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  47.52 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  48.42 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  45.95 
 
 		 431 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  49.66 
 
 		 435 aa  411  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2663  adenylosuccinate lyase  47.97 
 
 		 434 aa  411  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  49.44 
 
 		 435 aa  411  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  48.99 
 
 		 435 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  49.44 
 
 		 435 aa  411  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  49.21 
 
 		 435 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0179  adenylosuccinate lyase  48.89 
 
 		 451 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0644035  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  46.4 
 
 		 431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  46.62 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  48.32 
 
 		 435 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0716  adenylosuccinate lyase  47.66 
 
 		 437 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  47.65 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  50.34 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  47.38 
 
 		 430 aa  401  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  51.16 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  50.34 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  48.88 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  45.5 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  45.8 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  45.8 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  45.15 
 
 		 431 aa  395  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  44.59 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  46.73 
 
 		 431 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0818  adenylosuccinate lyase  46.62 
 
 		 425 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1610  adenylosuccinate lyase  46.53 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1446  adenylosuccinate lyase  45.09 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000278594  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  44.94 
 
 		 431 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3693  adenylosuccinate lyase  46.41 
 
 		 458 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1068  adenylosuccinate lyase  48.43 
 
 		 438 aa  388  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0025797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  45.33 
 
 		 431 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  45.37 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  45.27 
 
 		 431 aa  385  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  44.37 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  45.33 
 
 		 432 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  44.37 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  44.72 
 
 		 433 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1139  adenylosuccinate lyase  47.33 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.863394  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  44.9 
 
 		 431 aa  385  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  43.24 
 
 		 451 aa  382  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1769  adenylosuccinate lyase  46.19 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.468404  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  44.82 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  45.05 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  42.79 
 
 		 451 aa  382  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  46.51 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  43.92 
 
 		 431 aa  384  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0059  adenylosuccinate lyase  44.87 
 
 		 432 aa  381  1e-104  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.169461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>