More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3831 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3831  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 476 aa  983    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0723  adenylosuccinate lyase  58.39 
 
 		 475 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.291552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3043  adenylosuccinate lyase  59.28 
 
 		 477 aa  580  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1922  adenylosuccinate lyase  57.57 
 
 		 476 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1640  adenylosuccinate lyase  57.36 
 
 		 476 aa  570  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0741  adenylosuccinate lyase  60.57 
 
 		 475 aa  566  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000408437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1129  adenylosuccinate lyase  57.14 
 
 		 476 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18087  adenylosuccinate lyase  55.08 
 
 		 499 aa  552  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2150  adenylosuccinate lyase  56.88 
 
 		 479 aa  547  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0326846  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1620  adenylosuccinate lyase  56.8 
 
 		 473 aa  542  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03070  adenylosuccinate lyase, putative  56.2 
 
 		 479 aa  528  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.468629  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0331  adenylosuccinate lyase  56.01 
 
 		 476 aa  523  1e-147  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84718  3-isopropylmalate dehydratase  56.58 
 
 		 483 aa  520  1e-146  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00000783625  normal  0.0902341 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06209  adenylosuccinate lyase (Eurofung)  53.24 
 
 		 489 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1402  adenylosuccinate lyase  34.2 
 
 		 483 aa  269  7e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.390874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0147  adenylosuccinate lyase  35.4 
 
 		 474 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0154  adenylosuccinate lyase  34.87 
 
 		 474 aa  266  8.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4439  adenylosuccinate lyase ; K01756 adenylosuccinate lyase  33.92 
 
 		 476 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00550594  hitchhiker  0.000234914 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10792  adenylosuccinate lyase  33.77 
 
 		 472 aa  255  9e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.99152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1613  adenylosuccinate lyase  33.99 
 
 		 481 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1783  adenylosuccinate lyase  34.37 
 
 		 475 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38040  adenylosuccinate lyase  34.53 
 
 		 476 aa  253  6e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6408  adenylosuccinate lyase  34.91 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5145  adenylosuccinate lyase  33.92 
 
 		 491 aa  248  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0580  adenylosuccinate lyase  34.42 
 
 		 476 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194315  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4949  adenylosuccinate lyase  34.42 
 
 		 475 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4566  adenylosuccinate lyase  34.2 
 
 		 477 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4654  adenylosuccinate lyase  34.2 
 
 		 475 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2434  adenylosuccinate lyase  32.85 
 
 		 476 aa  239  8e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114262  normal  0.241079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6888  adenylosuccinate lyase  32.59 
 
 		 476 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5086  adenylosuccinate lyase  32.18 
 
 		 496 aa  236  9e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3624  adenylosuccinate lyase  31.32 
 
 		 475 aa  232  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0838  adenylosuccinate lyase  31.85 
 
 		 479 aa  225  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2128  adenylosuccinate lyase  34.41 
 
 		 475 aa  223  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4341  adenylosuccinate lyase  32.38 
 
 		 476 aa  223  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1941  adenylosuccinate lyase  30.97 
 
 		 474 aa  207  3e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324214  normal  0.0794487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  30.92 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  29.32 
 
 		 448 aa  176  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  29.39 
 
 		 446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  31.56 
 
 		 445 aa  173  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  29.23 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  32.64 
 
 		 431 aa  166  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  29.69 
 
 		 446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  29.8 
 
 		 431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  30.58 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  29.01 
 
 		 449 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1011  adenylosuccinate lyase  29.8 
 
 		 431 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  28.79 
 
 		 448 aa  162  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  29.18 
 
 		 431 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  30.62 
 
 		 430 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  28.1 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  28.76 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  30.42 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  28.32 
 
 		 451 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  28.26 
 
 		 430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  28.07 
 
 		 435 aa  156  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  28.11 
 
 		 431 aa  156  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  28.06 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  27.53 
 
 		 431 aa  155  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  28.32 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  28.79 
 
 		 431 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  28.79 
 
 		 431 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  26.72 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  29.27 
 
 		 431 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  27.18 
 
 		 431 aa  154  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  27.18 
 
 		 431 aa  154  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  28.61 
 
 		 433 aa  154  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  29.59 
 
 		 430 aa  154  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  27.57 
 
 		 435 aa  153  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  27.57 
 
 		 435 aa  153  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  27.32 
 
 		 435 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  27.32 
 
 		 435 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1118  adenylosuccinate lyase  29.28 
 
 		 446 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.984181  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  27.32 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  27.32 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  27.32 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  27.32 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  29.74 
 
 		 430 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0219  adenylosuccinate lyase  28.72 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  29.23 
 
 		 449 aa  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  27.07 
 
 		 435 aa  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  28.28 
 
 		 431 aa  150  4e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  26.46 
 
 		 432 aa  150  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1108  adenylosuccinate lyase  28.44 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.34197  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  28.21 
 
 		 431 aa  150  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  26.92 
 
 		 430 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  26.92 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  29.01 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  30.21 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  28.24 
 
 		 431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  28.07 
 
 		 431 aa  146  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1351  adenylosuccinate lyase  27.25 
 
 		 448 aa  146  9e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0804314  normal  0.668608 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  29.63 
 
 		 425 aa  146  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1058  adenylosuccinate lyase  29.9 
 
 		 436 aa  146  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  27.39 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  26.92 
 
 		 431 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  28.78 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1423  adenylosuccinate lyase  28.61 
 
 		 435 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2293  adenylosuccinate lyase  29.35 
 
 		 441 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.0141392 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0766  adenylosuccinate lyase  28.21 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.401492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>